RNA–Protein interactions for RNA: YMR001C-A

YMR001C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR001C-A, Length 231 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR001C-AYMR001C-A MTC1P47018 478 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
YMR001C-AYMR001C-A FAP1P53971 965 aa14.19□□□□□ -0.14
YMR001C-AYMR001C-A PRY3P47033 881 aa13.41□□□□□ -0.26
YMR001C-AYMR001C-A AAD16Q02895 342 aa12.89□□□□□ -0.35
YMR001C-AYMR001C-A PRI1P10363 409 aa12.88□□□□□ -0.35
YMR001C-AYMR001C-A DRS1P32892 752 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
YMR001C-AYMR001C-A YCK3P39962 524 aa12.8□□□□□ -0.36
YMR001C-AYMR001C-A HAA1Q12753 694 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
YMR001C-AYMR001C-A ISW2Q08773 1120 aa12.26□□□□□ -0.45
YMR001C-AYMR001C-A RPG1P38249 964 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
YMR001C-AYMR001C-A TSR3Q12094 313 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
YMR001C-AYMR001C-A MRPL32P25348 183 aa11.59□□□□□ -0.55
YMR001C-AYMR001C-A DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
YMR001C-AYMR001C-A YGL015CP33199 130 aa11.36□□□□□ -0.59
YMR001C-AYMR001C-A RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
YMR001C-AYMR001C-A RPL17AP05740 184 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
YMR001C-AYMR001C-A RPL17BP46990 184 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
YMR001C-AYMR001C-A REB1P21538 810 aa11.06□□□□□ -0.64
YMR001C-AYMR001C-A CDC27P38042 758 aa10.97□□□□□ -0.65
YMR001C-AYMR001C-A AVT3P36062 692 aa10.87□□□□□ -0.67
YMR001C-AYMR001C-A BUD31P25337 157 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
YMR001C-AYMR001C-A YKR023WP36119 530 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
YMR001C-AYMR001C-A MAP2P38174 421 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
YMR001C-AYMR001C-A UBP10P53874 792 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
YMR001C-AYMR001C-A BFR2Q06631 534 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
YMR001C-AYMR001C-A SPT21P35209 758 aa10.59□□□□□ -0.71
YMR001C-AYMR001C-A DCD1P06773 312 aa10.5□□□□□ -0.73
YMR001C-AYMR001C-A HOP09932 586 aa10.48□□□□□ -0.73
YMR001C-AYMR001C-A TFC8Q12308 588 aa10.45□□□□□ -0.74
YMR001C-AYMR001C-A SCY1P53009 804 aa10.29□□□□□ -0.76
YMR001C-AYMR001C-A SIS1P25294 352 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
YMR001C-AYMR001C-A TGL3P40308 642 aa10.2□□□□□ -0.78
YMR001C-AYMR001C-A SLX5P32828 619 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
YMR001C-AYMR001C-A TIF4632P39936 914 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
YMR001C-AYMR001C-A BCH2P36122 765 aa10.09□□□□□ -0.79
YMR001C-AYMR001C-A UBP9P39967 754 aa10.09□□□□□ -0.79
YMR001C-AYMR001C-A RIM101P33400 625 aa9.99□□□□□ -0.81
YMR001C-AYMR001C-A BDF1P35817 686 aa9.74□□□□□ -0.85
YMR001C-AYMR001C-A EPS1P40557 701 aa9.74□□□□□ -0.85
YMR001C-AYMR001C-A YBL029C-AQ3E756 94 aa9.71□□□□□ -0.86
YMR001C-AYMR001C-A MST1P07236 462 aa9.7□□□□□ -0.86
YMR001C-AYMR001C-A OXP1P28273 1286 aa9.69□□□□□ -0.86
YMR001C-AYMR001C-A YOR238WQ08634 303 aa9.57□□□□□ -0.88
YMR001C-AYMR001C-A VNX1P42839 908 aa9.55□□□□□ -0.88
YMR001C-AYMR001C-A NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data9.45□□□□□ -0.9not detected
YMR001C-AYMR001C-A PTP3P40048 928 aa9.45□□□□□ -0.9
YMR001C-AYMR001C-A SPP1Q03012 353 aa9.41□□□□□ -0.9
YMR001C-AYMR001C-A YIL055CP40523 627 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
YMR001C-AYMR001C-A WSC3Q12215 556 aa9.4□□□□□ -0.9
YMR001C-AYMR001C-A YAP5P40574 245 aa9.37□□□□□ -0.91
YMR001C-AYMR001C-A AIR2Q12476 344 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
YMR001C-AYMR001C-A AI2P03876 854 aa9.32□□□□□ -0.92
YMR001C-AYMR001C-A RSM7P47150 247 aa9.32□□□□□ -0.92
YMR001C-AYMR001C-A TFA1P36100 482 aa9.3□□□□□ -0.92
YMR001C-AYMR001C-A BBC1P47068 1157 aa9.3□□□□□ -0.92
YMR001C-AYMR001C-A FKH1P40466 484 aa9.29□□□□□ -0.92
YMR001C-AYMR001C-A TIF11P38912 153 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
YMR001C-AYMR001C-A YJL171CP46992 396 aa9.21□□□□□ -0.94
YMR001C-AYMR001C-A YAH1Q12184 172 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
YMR001C-AYMR001C-A GTT3P39996 337 aa9.15□□□□□ -0.94
YMR001C-AYMR001C-A IOC2Q12072 812 aa9.15□□□□□ -0.94
YMR001C-AYMR001C-A LDB19Q12502 818 aa9.15□□□□□ -0.94
YMR001C-AYMR001C-A PIB1Q06651 286 aa9.13□□□□□ -0.95
YMR001C-AYMR001C-A ULI1P43604 169 aa9.12□□□□□ -0.95
YMR001C-AYMR001C-A YLR271WQ06152 274 aa9.05□□□□□ -0.96
YMR001C-AYMR001C-A BMT6Q12291 365 aa9.05□□□□□ -0.96
YMR001C-AYMR001C-A PSD2P53037 1138 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
YMR001C-AYMR001C-A MRM1P25270 412 aa8.95□□□□□ -0.98
YMR001C-AYMR001C-A RTG1P32607 177 aa8.91□□□□□ -0.98
YMR001C-AYMR001C-A MSB4Q12317 492 aa8.91□□□□□ -0.98
YMR001C-AYMR001C-A TRP5P00931 707 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
YMR001C-AYMR001C-A SET4P42948 560 aa8.89□□□□□ -0.99
YMR001C-AYMR001C-A YOL036WQ08206 761 aa8.89□□□□□ -0.99
YMR001C-AYMR001C-A EAP1P36041 632 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
YMR001C-AYMR001C-A NCR1Q12200 1170 aa8.85□□□□□ -0.99
YMR001C-AYMR001C-A SSP1P38871 571 aa8.83□□□□□ -1
YMR001C-AYMR001C-A VPS29P38759 282 aa8.81□□□□□ -1
YMR001C-AYMR001C-A YFR006WP43590 535 aa8.79□□□□□ -1
YMR001C-AYMR001C-A DBP1P24784 617 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
YMR001C-AYMR001C-A YNL035CP53962 389 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
YMR001C-AYMR001C-A YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data8.76□□□□□ -1.01not detected
YMR001C-AYMR001C-A SEC61P32915 480 aa8.75□□□□□ -1.01
YMR001C-AYMR001C-A ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data8.74□□□□□ -1.01not detected
YMR001C-AYMR001C-A VMA1P17255 1071 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
YMR001C-AYMR001C-A STS1P38637 319 aa8.73□□□□□ -1.01
YMR001C-AYMR001C-A CST9Q06032 482 aa8.7□□□□□ -1.02
YMR001C-AYMR001C-A SAM3Q08986 587 aa8.7□□□□□ -1.02
YMR001C-AYMR001C-A DAN4P47179 1161 aa8.67□□□□□ -1.02
YMR001C-AYMR001C-A RTG3P38165 486 aa8.64□□□□□ -1.03
YMR001C-AYMR001C-A SAP30P38429 201 aa8.64□□□□□ -1.03
YMR001C-AYMR001C-A RCR1P38212 213 aa8.61□□□□□ -1.03
YMR001C-AYMR001C-A MGA2P40578 1113 aa8.6□□□□□ -1.03
YMR001C-AYMR001C-A BCK2P33306 851 aa8.58□□□□□ -1.04
YMR001C-AYMR001C-A TFG1P41895 735 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
YMR001C-AYMR001C-A YDL129WQ07555 291 aa8.55□□□□□ -1.04
YMR001C-AYMR001C-A CHL1P22516 861 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
YMR001C-AYMR001C-A JIP4Q03361 876 aa8.54□□□□□ -1.04
YMR001C-AYMR001C-A GYP5Q12344 894 aa8.52□□□□□ -1.05
YMR001C-AYMR001C-A PRE3P38624 215 aa8.51□□□□□ -1.05
YMR001C-AYMR001C-A DCW1P36091 449 aa8.5□□□□□ -1.05
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