Protein–RNA interactions for Protein: P53978

HEF3, Elongation factor 3B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEF3P53978 YML009W-BYML009W-B 477 nt25.92■■□□□ 1.74
HEF3P53978 NSR1YGR159C 1245 nt25.6■■□□□ 1.69
HEF3P53978 NOP1YDL014W 984 nt25.01■■□□□ 1.59
HEF3P53978 YKL036CYKL036C 393 nt23.15■■□□□ 1.3
HEF3P53978 MDJ1YFL016C 1536 nt22.97■■□□□ 1.27
HEF3P53978 Q0297Q0297 156 nt21.93■■□□□ 1.1
HEF3P53978 SRX1YKL086W 384 nt21.91■■□□□ 1.1
HEF3P53978 YJL027CYJL027C 417 nt21.65■■□□□ 1.06
HEF3P53978 SCS3YGL126W 1143 nt21.15■□□□□ 0.98
HEF3P53978 YCR051WYCR051W 669 nt20.88■□□□□ 0.93
HEF3P53978 DBP2YNL112W 1641 nt20.28■□□□□ 0.84
HEF3P53978 YOL085CYOL085C 342 nt20.11■□□□□ 0.81
HEF3P53978 PKP1YIL042C 1185 nt19.94■□□□□ 0.78
HEF3P53978 TRN1tP(UGG)A 72 nt19.87■□□□□ 0.77
HEF3P53978 SUF9tP(UGG)F 72 nt19.87■□□□□ 0.77
HEF3P53978 SUF8tP(UGG)H 72 nt19.87■□□□□ 0.77
HEF3P53978 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt19.87■□□□□ 0.77
HEF3P53978 SUF7tP(UGG)M 72 nt19.87■□□□□ 0.77
HEF3P53978 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt19.87■□□□□ 0.77
HEF3P53978 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt19.87■□□□□ 0.77
HEF3P53978 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt19.87■□□□□ 0.77
HEF3P53978 SUF11tP(UGG)O2 72 nt19.87■□□□□ 0.77
HEF3P53978 CCC1YLR220W 969 nt19.77■□□□□ 0.76
HEF3P53978 RPP1BYDL130W 321 nt19.71■□□□□ 0.75
HEF3P53978 YBR190WYBR190W 312 nt19.4■□□□□ 0.7
HEF3P53978 RTC3YHR087W 336 nt19.07■□□□□ 0.64
HEF3P53978 SCJ1YMR214W 1134 nt19.02■□□□□ 0.64
HEF3P53978 PET122YER153C 765 nt18.94■□□□□ 0.62
HEF3P53978 RVS167YDR388W 1449 nt18.9■□□□□ 0.62
HEF3P53978 ATS1YAL020C 1002 nt18.87■□□□□ 0.61
HEF3P53978 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt18.81■□□□□ 0.6
HEF3P53978 SCR1SCR1 522 nt18.58■□□□□ 0.56
HEF3P53978 RRN5YLR141W 1092 nt18.37■□□□□ 0.53
HEF3P53978 SHR5YOL110W 714 nt18.29■□□□□ 0.52
HEF3P53978 YDJ1YNL064C 1230 nt18.09■□□□□ 0.49
HEF3P53978 YER088W-BYER088W-B 147 nt18■□□□□ 0.47
HEF3P53978 RSB1YOR049C 1065 nt17.99■□□□□ 0.47
HEF3P53978 DEP1YAL013W 1218 nt17.95■□□□□ 0.46
HEF3P53978 URN1YPR152C 1398 nt17.85■□□□□ 0.45
HEF3P53978 GAR1YHR089C 618 nt17.84■□□□□ 0.45
HEF3P53978 PUT4YOR348C 1884 nt17.71■□□□□ 0.43
HEF3P53978 OPI9YLR338W 858 nt17.53■□□□□ 0.4
HEF3P53978 SAH1YER043C 1350 nt17.53■□□□□ 0.4
HEF3P53978 YNL208WYNL208W 600 nt17.48■□□□□ 0.39
HEF3P53978 PST2YDR032C 597 nt17.47■□□□□ 0.39
HEF3P53978 RPN10YHR200W 807 nt17.43■□□□□ 0.38
HEF3P53978 ARE1YCR048W 1833 nt17.42■□□□□ 0.38
HEF3P53978 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt17.21■□□□□ 0.35
HEF3P53978 POA1YBR022W 534 nt17.21■□□□□ 0.35
HEF3P53978 TIR1YER011W 765 nt17.19■□□□□ 0.34
HEF3P53978 SSA1YAL005C 1929 nt17.06■□□□□ 0.32
HEF3P53978 YJR018WYJR018W 363 nt16.99■□□□□ 0.31
HEF3P53978 PUN1YLR414C 792 nt16.97■□□□□ 0.31
HEF3P53978 SRB2YHR041C 633 nt16.91■□□□□ 0.3
HEF3P53978 PTC2YER089C 1395 nt16.89■□□□□ 0.29
HEF3P53978 SHU1YHL006C 453 nt16.85■□□□□ 0.29
HEF3P53978 YJR120WYJR120W 351 nt16.85■□□□□ 0.29
HEF3P53978 BUD23YCR047C 828 nt16.83■□□□□ 0.28
HEF3P53978 BSC6YOL137W 1494 nt16.82■□□□□ 0.28
HEF3P53978 YKL097CYKL097C 411 nt16.77■□□□□ 0.28
HEF3P53978 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt16.68■□□□□ 0.26
HEF3P53978 RPP2BYDR382W 333 nt16.57■□□□□ 0.24
HEF3P53978 NAB2YGL122C 1578 nt16.56■□□□□ 0.24
HEF3P53978 WWM1YFL010C 636 nt16.51■□□□□ 0.23
HEF3P53978 SSA3YBL075C 1950 nt16.46■□□□□ 0.23
HEF3P53978 FPR4YLR449W 1179 nt16.45■□□□□ 0.22
HEF3P53978 FIS1YIL065C 468 nt16.44■□□□□ 0.22
HEF3P53978 DAL1YIR027C 1383 nt16.38■□□□□ 0.21
HEF3P53978 MNP1YGL068W 585 nt16.33■□□□□ 0.2
HEF3P53978 INM2YDR287W 879 nt16.29■□□□□ 0.2
HEF3P53978 HOM6YJR139C 1080 nt16.29■□□□□ 0.2
HEF3P53978 PHO4YFR034C 939 nt16.28■□□□□ 0.2
HEF3P53978 BDH2YAL061W 1254 nt16.28■□□□□ 0.2
HEF3P53978 YBL100CYBL100C 315 nt16.24■□□□□ 0.19
HEF3P53978 YGR021WYGR021W 873 nt16.23■□□□□ 0.19
HEF3P53978 YOR139CYOR139C 393 nt16.19■□□□□ 0.18
HEF3P53978 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt16.1■□□□□ 0.17
HEF3P53978 FUN26YAL022C 1554 nt16.05■□□□□ 0.16
HEF3P53978 RKM5YLR137W 1104 nt16.05■□□□□ 0.16
HEF3P53978 LSM3YLR438C-A 270 nt15.99■□□□□ 0.15
HEF3P53978 NPL3YDR432W 1245 nt15.97■□□□□ 0.15
HEF3P53978 SPT5YML010W 3192 nt15.97■□□□□ 0.15
HEF3P53978 TRM9YML014W 840 nt15.96■□□□□ 0.15
HEF3P53978 YPS1YLR120C 1710 nt15.93■□□□□ 0.14
HEF3P53978 YOL037CYOL037C 354 nt15.84■□□□□ 0.13
HEF3P53978 YDR095CYDR095C 411 nt15.82■□□□□ 0.12
HEF3P53978 CCT6YDR188W 1641 nt15.79■□□□□ 0.12
HEF3P53978 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt15.78■□□□□ 0.12
HEF3P53978 ALF1YNL148C 765 nt15.78■□□□□ 0.12
HEF3P53978 MEP2YNL142W 1500 nt15.73■□□□□ 0.11
HEF3P53978 DCW1YKL046C 1350 nt15.61■□□□□ 0.09
HEF3P53978 SUF2tP(AGG)C 72 nt15.6■□□□□ 0.09
HEF3P53978 SUF10tP(AGG)N 72 nt15.6■□□□□ 0.09
HEF3P53978 PTP1YDL230W 1008 nt15.54■□□□□ 0.08
HEF3P53978 YLR281CYLR281C 468 nt15.54■□□□□ 0.08
HEF3P53978 SIS1YNL007C 1059 nt15.54■□□□□ 0.08
HEF3P53978 WHI5YOR083W 888 nt15.54■□□□□ 0.08
HEF3P53978 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt15.53■□□□□ 0.08
HEF3P53978 IMT4tM(CAU)E 72 nt15.53■□□□□ 0.08
HEF3P53978 IMT3tM(CAU)J3 72 nt15.53■□□□□ 0.08
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