Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X5

NPFFR2, Neuropeptide FF receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPFFR2Q9Y5X5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPFFR2Q9Y5X5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPFFR2Q9Y5X5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPFFR2Q9Y5X5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPFFR2Q9Y5X5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPFFR2Q9Y5X5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPFFR2Q9Y5X5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPFFR2Q9Y5X5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPFFR2Q9Y5X5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPFFR2Q9Y5X5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPFFR2Q9Y5X5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPFFR2Q9Y5X5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPFFR2Q9Y5X5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NPFFR2Q9Y5X5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NPFFR2Q9Y5X5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NPFFR2Q9Y5X5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NPFFR2Q9Y5X5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPFFR2Q9Y5X5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPFFR2Q9Y5X5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPFFR2Q9Y5X5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPFFR2Q9Y5X5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPFFR2Q9Y5X5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPFFR2Q9Y5X5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NPFFR2Q9Y5X5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPFFR2Q9Y5X5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPFFR2Q9Y5X5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPFFR2Q9Y5X5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NPFFR2Q9Y5X5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPFFR2Q9Y5X5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPFFR2Q9Y5X5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPFFR2Q9Y5X5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPFFR2Q9Y5X5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPFFR2Q9Y5X5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPFFR2Q9Y5X5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPFFR2Q9Y5X5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NPFFR2Q9Y5X5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPFFR2Q9Y5X5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPFFR2Q9Y5X5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPFFR2Q9Y5X5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPFFR2Q9Y5X5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NPFFR2Q9Y5X5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPFFR2Q9Y5X5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPFFR2Q9Y5X5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPFFR2Q9Y5X5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPFFR2Q9Y5X5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPFFR2Q9Y5X5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPFFR2Q9Y5X5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NPFFR2Q9Y5X5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPFFR2Q9Y5X5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPFFR2Q9Y5X5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPFFR2Q9Y5X5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NPFFR2Q9Y5X5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPFFR2Q9Y5X5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPFFR2Q9Y5X5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPFFR2Q9Y5X5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPFFR2Q9Y5X5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPFFR2Q9Y5X5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NPFFR2Q9Y5X5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPFFR2Q9Y5X5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPFFR2Q9Y5X5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPFFR2Q9Y5X5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPFFR2Q9Y5X5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPFFR2Q9Y5X5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPFFR2Q9Y5X5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPFFR2Q9Y5X5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPFFR2Q9Y5X5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPFFR2Q9Y5X5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPFFR2Q9Y5X5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPFFR2Q9Y5X5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPFFR2Q9Y5X5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NPFFR2Q9Y5X5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPFFR2Q9Y5X5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NPFFR2Q9Y5X5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPFFR2Q9Y5X5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPFFR2Q9Y5X5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPFFR2Q9Y5X5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPFFR2Q9Y5X5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPFFR2Q9Y5X5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPFFR2Q9Y5X5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPFFR2Q9Y5X5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NPFFR2Q9Y5X5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPFFR2Q9Y5X5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPFFR2Q9Y5X5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPFFR2Q9Y5X5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NPFFR2Q9Y5X5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPFFR2Q9Y5X5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPFFR2Q9Y5X5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPFFR2Q9Y5X5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPFFR2Q9Y5X5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPFFR2Q9Y5X5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPFFR2Q9Y5X5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPFFR2Q9Y5X5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPFFR2Q9Y5X5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPFFR2Q9Y5X5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPFFR2Q9Y5X5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPFFR2Q9Y5X5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPFFR2Q9Y5X5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPFFR2Q9Y5X5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPFFR2Q9Y5X5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NPFFR2Q9Y5X5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118 ms