Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4U1

MMACHC, Methylmalonic aciduria and homocystinuria type C protein, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMACHCQ9Y4U1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMACHCQ9Y4U1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMACHCQ9Y4U1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MMACHCQ9Y4U1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMACHCQ9Y4U1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMACHCQ9Y4U1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MMACHCQ9Y4U1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMACHCQ9Y4U1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MMACHCQ9Y4U1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MMACHCQ9Y4U1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMACHCQ9Y4U1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MMACHCQ9Y4U1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MMACHCQ9Y4U1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMACHCQ9Y4U1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MMACHCQ9Y4U1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MMACHCQ9Y4U1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMACHCQ9Y4U1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MMACHCQ9Y4U1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMACHCQ9Y4U1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMACHCQ9Y4U1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MMACHCQ9Y4U1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMACHCQ9Y4U1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMACHCQ9Y4U1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMACHCQ9Y4U1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMACHCQ9Y4U1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMACHCQ9Y4U1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMACHCQ9Y4U1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMACHCQ9Y4U1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMACHCQ9Y4U1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMACHCQ9Y4U1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMACHCQ9Y4U1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMACHCQ9Y4U1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMACHCQ9Y4U1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMACHCQ9Y4U1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMACHCQ9Y4U1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
MMACHCQ9Y4U1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMACHCQ9Y4U1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMACHCQ9Y4U1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMACHCQ9Y4U1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMACHCQ9Y4U1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMACHCQ9Y4U1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMACHCQ9Y4U1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MMACHCQ9Y4U1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMACHCQ9Y4U1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMACHCQ9Y4U1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMACHCQ9Y4U1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMACHCQ9Y4U1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMACHCQ9Y4U1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMACHCQ9Y4U1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMACHCQ9Y4U1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMACHCQ9Y4U1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMACHCQ9Y4U1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMACHCQ9Y4U1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMACHCQ9Y4U1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMACHCQ9Y4U1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMACHCQ9Y4U1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMACHCQ9Y4U1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMACHCQ9Y4U1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMACHCQ9Y4U1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMACHCQ9Y4U1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMACHCQ9Y4U1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMACHCQ9Y4U1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMACHCQ9Y4U1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MMACHCQ9Y4U1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMACHCQ9Y4U1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMACHCQ9Y4U1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMACHCQ9Y4U1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMACHCQ9Y4U1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMACHCQ9Y4U1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMACHCQ9Y4U1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMACHCQ9Y4U1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMACHCQ9Y4U1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMACHCQ9Y4U1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MMACHCQ9Y4U1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMACHCQ9Y4U1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMACHCQ9Y4U1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMACHCQ9Y4U1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMACHCQ9Y4U1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMACHCQ9Y4U1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMACHCQ9Y4U1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMACHCQ9Y4U1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMACHCQ9Y4U1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MMACHCQ9Y4U1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMACHCQ9Y4U1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMACHCQ9Y4U1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMACHCQ9Y4U1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMACHCQ9Y4U1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMACHCQ9Y4U1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MMACHCQ9Y4U1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMACHCQ9Y4U1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMACHCQ9Y4U1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMACHCQ9Y4U1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMACHCQ9Y4U1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMACHCQ9Y4U1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMACHCQ9Y4U1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MMACHCQ9Y4U1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MMACHCQ9Y4U1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMACHCQ9Y4U1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMACHCQ9Y4U1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MMACHCQ9Y4U1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms