Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CHTOPQ9Y3Y2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHTOPQ9Y3Y2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHTOPQ9Y3Y2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHTOPQ9Y3Y2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CHTOPQ9Y3Y2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHTOPQ9Y3Y2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHTOPQ9Y3Y2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CHTOPQ9Y3Y2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHTOPQ9Y3Y2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHTOPQ9Y3Y2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHTOPQ9Y3Y2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHTOPQ9Y3Y2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CHTOPQ9Y3Y2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHTOPQ9Y3Y2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHTOPQ9Y3Y2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CHTOPQ9Y3Y2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CHTOPQ9Y3Y2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHTOPQ9Y3Y2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHTOPQ9Y3Y2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHTOPQ9Y3Y2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHTOPQ9Y3Y2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CHTOPQ9Y3Y2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHTOPQ9Y3Y2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CHTOPQ9Y3Y2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHTOPQ9Y3Y2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CHTOPQ9Y3Y2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHTOPQ9Y3Y2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHTOPQ9Y3Y2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHTOPQ9Y3Y2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHTOPQ9Y3Y2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHTOPQ9Y3Y2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CHTOPQ9Y3Y2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CHTOPQ9Y3Y2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHTOPQ9Y3Y2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHTOPQ9Y3Y2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHTOPQ9Y3Y2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHTOPQ9Y3Y2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHTOPQ9Y3Y2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHTOPQ9Y3Y2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CHTOPQ9Y3Y2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CHTOPQ9Y3Y2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHTOPQ9Y3Y2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CHTOPQ9Y3Y2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHTOPQ9Y3Y2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHTOPQ9Y3Y2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CHTOPQ9Y3Y2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHTOPQ9Y3Y2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHTOPQ9Y3Y2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHTOPQ9Y3Y2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CHTOPQ9Y3Y2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHTOPQ9Y3Y2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHTOPQ9Y3Y2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHTOPQ9Y3Y2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHTOPQ9Y3Y2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHTOPQ9Y3Y2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHTOPQ9Y3Y2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHTOPQ9Y3Y2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHTOPQ9Y3Y2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHTOPQ9Y3Y2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHTOPQ9Y3Y2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHTOPQ9Y3Y2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHTOPQ9Y3Y2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHTOPQ9Y3Y2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHTOPQ9Y3Y2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHTOPQ9Y3Y2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CHTOPQ9Y3Y2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHTOPQ9Y3Y2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHTOPQ9Y3Y2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHTOPQ9Y3Y2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHTOPQ9Y3Y2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHTOPQ9Y3Y2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHTOPQ9Y3Y2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHTOPQ9Y3Y2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHTOPQ9Y3Y2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHTOPQ9Y3Y2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHTOPQ9Y3Y2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHTOPQ9Y3Y2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHTOPQ9Y3Y2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHTOPQ9Y3Y2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHTOPQ9Y3Y2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHTOPQ9Y3Y2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHTOPQ9Y3Y2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHTOPQ9Y3Y2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHTOPQ9Y3Y2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHTOPQ9Y3Y2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHTOPQ9Y3Y2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHTOPQ9Y3Y2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHTOPQ9Y3Y2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHTOPQ9Y3Y2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHTOPQ9Y3Y2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHTOPQ9Y3Y2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHTOPQ9Y3Y2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHTOPQ9Y3Y2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHTOPQ9Y3Y2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CHTOPQ9Y3Y2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHTOPQ9Y3Y2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms