Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HCN4Q9Y3Q4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HCN4Q9Y3Q4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HCN4Q9Y3Q4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HCN4Q9Y3Q4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HCN4Q9Y3Q4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HCN4Q9Y3Q4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HCN4Q9Y3Q4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HCN4Q9Y3Q4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
HCN4Q9Y3Q4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HCN4Q9Y3Q4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HCN4Q9Y3Q4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HCN4Q9Y3Q4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HCN4Q9Y3Q4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HCN4Q9Y3Q4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HCN4Q9Y3Q4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HCN4Q9Y3Q4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HCN4Q9Y3Q4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HCN4Q9Y3Q4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HCN4Q9Y3Q4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HCN4Q9Y3Q4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HCN4Q9Y3Q4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HCN4Q9Y3Q4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
HCN4Q9Y3Q4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HCN4Q9Y3Q4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HCN4Q9Y3Q4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HCN4Q9Y3Q4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HCN4Q9Y3Q4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HCN4Q9Y3Q4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HCN4Q9Y3Q4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HCN4Q9Y3Q4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HCN4Q9Y3Q4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HCN4Q9Y3Q4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HCN4Q9Y3Q4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HCN4Q9Y3Q4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HCN4Q9Y3Q4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HCN4Q9Y3Q4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HCN4Q9Y3Q4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HCN4Q9Y3Q4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
HCN4Q9Y3Q4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HCN4Q9Y3Q4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HCN4Q9Y3Q4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HCN4Q9Y3Q4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HCN4Q9Y3Q4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HCN4Q9Y3Q4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HCN4Q9Y3Q4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HCN4Q9Y3Q4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HCN4Q9Y3Q4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HCN4Q9Y3Q4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HCN4Q9Y3Q4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HCN4Q9Y3Q4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HCN4Q9Y3Q4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HCN4Q9Y3Q4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HCN4Q9Y3Q4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HCN4Q9Y3Q4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HCN4Q9Y3Q4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HCN4Q9Y3Q4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HCN4Q9Y3Q4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HCN4Q9Y3Q4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HCN4Q9Y3Q4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HCN4Q9Y3Q4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HCN4Q9Y3Q4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HCN4Q9Y3Q4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HCN4Q9Y3Q4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HCN4Q9Y3Q4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HCN4Q9Y3Q4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HCN4Q9Y3Q4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HCN4Q9Y3Q4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HCN4Q9Y3Q4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HCN4Q9Y3Q4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HCN4Q9Y3Q4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HCN4Q9Y3Q4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HCN4Q9Y3Q4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HCN4Q9Y3Q4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HCN4Q9Y3Q4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
HCN4Q9Y3Q4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HCN4Q9Y3Q4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HCN4Q9Y3Q4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HCN4Q9Y3Q4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HCN4Q9Y3Q4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HCN4Q9Y3Q4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HCN4Q9Y3Q4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HCN4Q9Y3Q4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HCN4Q9Y3Q4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HCN4Q9Y3Q4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HCN4Q9Y3Q4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HCN4Q9Y3Q4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HCN4Q9Y3Q4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HCN4Q9Y3Q4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HCN4Q9Y3Q4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HCN4Q9Y3Q4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HCN4Q9Y3Q4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
HCN4Q9Y3Q4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HCN4Q9Y3Q4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HCN4Q9Y3Q4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HCN4Q9Y3Q4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HCN4Q9Y3Q4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HCN4Q9Y3Q4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HCN4Q9Y3Q4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HCN4Q9Y3Q4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms