Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC4Q9Y296 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAPPC4Q9Y296 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC4Q9Y296 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC4Q9Y296 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC4Q9Y296 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC4Q9Y296 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC4Q9Y296 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC4Q9Y296 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC4Q9Y296 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC4Q9Y296 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC4Q9Y296 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC4Q9Y296 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC4Q9Y296 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRAPPC4Q9Y296 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC4Q9Y296 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAPPC4Q9Y296 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC4Q9Y296 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC4Q9Y296 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC4Q9Y296 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAPPC4Q9Y296 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC4Q9Y296 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAPPC4Q9Y296 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC4Q9Y296 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC4Q9Y296 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC4Q9Y296 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC4Q9Y296 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC4Q9Y296 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC4Q9Y296 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAPPC4Q9Y296 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC4Q9Y296 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC4Q9Y296 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAPPC4Q9Y296 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC4Q9Y296 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC4Q9Y296 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAPPC4Q9Y296 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC4Q9Y296 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC4Q9Y296 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC4Q9Y296 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAPPC4Q9Y296 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC4Q9Y296 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAPPC4Q9Y296 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC4Q9Y296 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC4Q9Y296 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC4Q9Y296 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRAPPC4Q9Y296 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC4Q9Y296 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC4Q9Y296 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC4Q9Y296 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAPPC4Q9Y296 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC4Q9Y296 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC4Q9Y296 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC4Q9Y296 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC4Q9Y296 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAPPC4Q9Y296 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC4Q9Y296 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC4Q9Y296 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC4Q9Y296 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC4Q9Y296 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC4Q9Y296 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAPPC4Q9Y296 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC4Q9Y296 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC4Q9Y296 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC4Q9Y296 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC4Q9Y296 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAPPC4Q9Y296 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAPPC4Q9Y296 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC4Q9Y296 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC4Q9Y296 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC4Q9Y296 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC4Q9Y296 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC4Q9Y296 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC4Q9Y296 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC4Q9Y296 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC4Q9Y296 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC4Q9Y296 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC4Q9Y296 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC4Q9Y296 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC4Q9Y296 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAPPC4Q9Y296 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC4Q9Y296 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC4Q9Y296 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC4Q9Y296 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC4Q9Y296 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAPPC4Q9Y296 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC4Q9Y296 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC4Q9Y296 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC4Q9Y296 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC4Q9Y296 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC4Q9Y296 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC4Q9Y296 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC4Q9Y296 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRAPPC4Q9Y296 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRAPPC4Q9Y296 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC4Q9Y296 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC4Q9Y296 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC4Q9Y296 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC4Q9Y296 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC4Q9Y296 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms