Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF6Q9Y252 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RNF6Q9Y252 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF6Q9Y252 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF6Q9Y252 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF6Q9Y252 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RNF6Q9Y252 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF6Q9Y252 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF6Q9Y252 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF6Q9Y252 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF6Q9Y252 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF6Q9Y252 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RNF6Q9Y252 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF6Q9Y252 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF6Q9Y252 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF6Q9Y252 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF6Q9Y252 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF6Q9Y252 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RNF6Q9Y252 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF6Q9Y252 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF6Q9Y252 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF6Q9Y252 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RNF6Q9Y252 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF6Q9Y252 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF6Q9Y252 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RNF6Q9Y252 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF6Q9Y252 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF6Q9Y252 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF6Q9Y252 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF6Q9Y252 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF6Q9Y252 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF6Q9Y252 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF6Q9Y252 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF6Q9Y252 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF6Q9Y252 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF6Q9Y252 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF6Q9Y252 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF6Q9Y252 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF6Q9Y252 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF6Q9Y252 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF6Q9Y252 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF6Q9Y252 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF6Q9Y252 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF6Q9Y252 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF6Q9Y252 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF6Q9Y252 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF6Q9Y252 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF6Q9Y252 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF6Q9Y252 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF6Q9Y252 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF6Q9Y252 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF6Q9Y252 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF6Q9Y252 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF6Q9Y252 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF6Q9Y252 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF6Q9Y252 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF6Q9Y252 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF6Q9Y252 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF6Q9Y252 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF6Q9Y252 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF6Q9Y252 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF6Q9Y252 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF6Q9Y252 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF6Q9Y252 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF6Q9Y252 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF6Q9Y252 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF6Q9Y252 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF6Q9Y252 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF6Q9Y252 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF6Q9Y252 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF6Q9Y252 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF6Q9Y252 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF6Q9Y252 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF6Q9Y252 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF6Q9Y252 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF6Q9Y252 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF6Q9Y252 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF6Q9Y252 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF6Q9Y252 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF6Q9Y252 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF6Q9Y252 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF6Q9Y252 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF6Q9Y252 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF6Q9Y252 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF6Q9Y252 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF6Q9Y252 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF6Q9Y252 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF6Q9Y252 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF6Q9Y252 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF6Q9Y252 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF6Q9Y252 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF6Q9Y252 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF6Q9Y252 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF6Q9Y252 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF6Q9Y252 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF6Q9Y252 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF6Q9Y252 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF6Q9Y252 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF6Q9Y252 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF6Q9Y252 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms