Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQK1

PPP1R3C, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3C, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3CQ9UQK1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R3CQ9UQK1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R3CQ9UQK1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R3CQ9UQK1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R3CQ9UQK1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R3CQ9UQK1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R3CQ9UQK1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R3CQ9UQK1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R3CQ9UQK1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1R3CQ9UQK1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3CQ9UQK1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R3CQ9UQK1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R3CQ9UQK1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R3CQ9UQK1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R3CQ9UQK1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R3CQ9UQK1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R3CQ9UQK1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R3CQ9UQK1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R3CQ9UQK1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3CQ9UQK1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3CQ9UQK1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3CQ9UQK1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R3CQ9UQK1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R3CQ9UQK1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R3CQ9UQK1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R3CQ9UQK1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1R3CQ9UQK1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1R3CQ9UQK1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1R3CQ9UQK1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1R3CQ9UQK1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP1R3CQ9UQK1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP1R3CQ9UQK1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP1R3CQ9UQK1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP1R3CQ9UQK1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP1R3CQ9UQK1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP1R3CQ9UQK1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP1R3CQ9UQK1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP1R3CQ9UQK1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP1R3CQ9UQK1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP1R3CQ9UQK1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP1R3CQ9UQK1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP1R3CQ9UQK1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPP1R3CQ9UQK1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP1R3CQ9UQK1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP1R3CQ9UQK1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP1R3CQ9UQK1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPP1R3CQ9UQK1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP1R3CQ9UQK1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPP1R3CQ9UQK1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP1R3CQ9UQK1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP1R3CQ9UQK1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPP1R3CQ9UQK1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP1R3CQ9UQK1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP1R3CQ9UQK1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP1R3CQ9UQK1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP1R3CQ9UQK1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP1R3CQ9UQK1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP1R3CQ9UQK1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP1R3CQ9UQK1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP1R3CQ9UQK1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP1R3CQ9UQK1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PPP1R3CQ9UQK1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP1R3CQ9UQK1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP1R3CQ9UQK1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP1R3CQ9UQK1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP1R3CQ9UQK1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPP1R3CQ9UQK1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP1R3CQ9UQK1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPP1R3CQ9UQK1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPP1R3CQ9UQK1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R3CQ9UQK1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R3CQ9UQK1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPP1R3CQ9UQK1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PPP1R3CQ9UQK1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R3CQ9UQK1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R3CQ9UQK1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPP1R3CQ9UQK1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R3CQ9UQK1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R3CQ9UQK1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R3CQ9UQK1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP1R3CQ9UQK1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R3CQ9UQK1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP1R3CQ9UQK1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R3CQ9UQK1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP1R3CQ9UQK1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP1R3CQ9UQK1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1R3CQ9UQK1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1R3CQ9UQK1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP1R3CQ9UQK1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PPP1R3CQ9UQK1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1R3CQ9UQK1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1R3CQ9UQK1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP1R3CQ9UQK1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R3CQ9UQK1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP1R3CQ9UQK1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R3CQ9UQK1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R3CQ9UQK1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R3CQ9UQK1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R3CQ9UQK1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP1R3CQ9UQK1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms