Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEU3Q9UQ49 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEU3Q9UQ49 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEU3Q9UQ49 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEU3Q9UQ49 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEU3Q9UQ49 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEU3Q9UQ49 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEU3Q9UQ49 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NEU3Q9UQ49 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEU3Q9UQ49 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEU3Q9UQ49 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEU3Q9UQ49 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEU3Q9UQ49 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEU3Q9UQ49 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEU3Q9UQ49 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEU3Q9UQ49 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEU3Q9UQ49 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEU3Q9UQ49 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEU3Q9UQ49 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEU3Q9UQ49 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEU3Q9UQ49 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEU3Q9UQ49 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEU3Q9UQ49 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEU3Q9UQ49 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEU3Q9UQ49 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEU3Q9UQ49 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEU3Q9UQ49 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEU3Q9UQ49 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEU3Q9UQ49 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEU3Q9UQ49 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEU3Q9UQ49 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEU3Q9UQ49 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NEU3Q9UQ49 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEU3Q9UQ49 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEU3Q9UQ49 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEU3Q9UQ49 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEU3Q9UQ49 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEU3Q9UQ49 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEU3Q9UQ49 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEU3Q9UQ49 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEU3Q9UQ49 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEU3Q9UQ49 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NEU3Q9UQ49 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEU3Q9UQ49 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NEU3Q9UQ49 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEU3Q9UQ49 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEU3Q9UQ49 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEU3Q9UQ49 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NEU3Q9UQ49 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEU3Q9UQ49 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEU3Q9UQ49 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEU3Q9UQ49 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEU3Q9UQ49 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEU3Q9UQ49 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEU3Q9UQ49 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NEU3Q9UQ49 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEU3Q9UQ49 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEU3Q9UQ49 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEU3Q9UQ49 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEU3Q9UQ49 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEU3Q9UQ49 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEU3Q9UQ49 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEU3Q9UQ49 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEU3Q9UQ49 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEU3Q9UQ49 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEU3Q9UQ49 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NEU3Q9UQ49 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NEU3Q9UQ49 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEU3Q9UQ49 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEU3Q9UQ49 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEU3Q9UQ49 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NEU3Q9UQ49 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NEU3Q9UQ49 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NEU3Q9UQ49 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEU3Q9UQ49 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NEU3Q9UQ49 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NEU3Q9UQ49 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEU3Q9UQ49 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEU3Q9UQ49 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEU3Q9UQ49 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NEU3Q9UQ49 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NEU3Q9UQ49 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEU3Q9UQ49 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NEU3Q9UQ49 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEU3Q9UQ49 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NEU3Q9UQ49 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NEU3Q9UQ49 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NEU3Q9UQ49 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEU3Q9UQ49 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEU3Q9UQ49 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEU3Q9UQ49 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEU3Q9UQ49 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NEU3Q9UQ49 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEU3Q9UQ49 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEU3Q9UQ49 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEU3Q9UQ49 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEU3Q9UQ49 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEU3Q9UQ49 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NEU3Q9UQ49 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NEU3Q9UQ49 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms