Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SORCS3Q9UPU3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SORCS3Q9UPU3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SORCS3Q9UPU3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SORCS3Q9UPU3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SORCS3Q9UPU3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SORCS3Q9UPU3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SORCS3Q9UPU3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SORCS3Q9UPU3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SORCS3Q9UPU3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SORCS3Q9UPU3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SORCS3Q9UPU3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SORCS3Q9UPU3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SORCS3Q9UPU3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SORCS3Q9UPU3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SORCS3Q9UPU3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SORCS3Q9UPU3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SORCS3Q9UPU3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SORCS3Q9UPU3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SORCS3Q9UPU3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SORCS3Q9UPU3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SORCS3Q9UPU3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SORCS3Q9UPU3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SORCS3Q9UPU3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SORCS3Q9UPU3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SORCS3Q9UPU3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SORCS3Q9UPU3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SORCS3Q9UPU3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SORCS3Q9UPU3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SORCS3Q9UPU3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SORCS3Q9UPU3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SORCS3Q9UPU3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SORCS3Q9UPU3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SORCS3Q9UPU3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SORCS3Q9UPU3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SORCS3Q9UPU3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SORCS3Q9UPU3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SORCS3Q9UPU3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SORCS3Q9UPU3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SORCS3Q9UPU3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SORCS3Q9UPU3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SORCS3Q9UPU3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SORCS3Q9UPU3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SORCS3Q9UPU3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SORCS3Q9UPU3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SORCS3Q9UPU3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SORCS3Q9UPU3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SORCS3Q9UPU3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SORCS3Q9UPU3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SORCS3Q9UPU3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SORCS3Q9UPU3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SORCS3Q9UPU3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SORCS3Q9UPU3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SORCS3Q9UPU3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SORCS3Q9UPU3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SORCS3Q9UPU3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SORCS3Q9UPU3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SORCS3Q9UPU3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SORCS3Q9UPU3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SORCS3Q9UPU3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SORCS3Q9UPU3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SORCS3Q9UPU3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SORCS3Q9UPU3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SORCS3Q9UPU3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SORCS3Q9UPU3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SORCS3Q9UPU3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SORCS3Q9UPU3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SORCS3Q9UPU3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SORCS3Q9UPU3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SORCS3Q9UPU3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SORCS3Q9UPU3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SORCS3Q9UPU3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SORCS3Q9UPU3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SORCS3Q9UPU3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SORCS3Q9UPU3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SORCS3Q9UPU3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SORCS3Q9UPU3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SORCS3Q9UPU3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SORCS3Q9UPU3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SORCS3Q9UPU3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SORCS3Q9UPU3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SORCS3Q9UPU3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SORCS3Q9UPU3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SORCS3Q9UPU3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SORCS3Q9UPU3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SORCS3Q9UPU3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SORCS3Q9UPU3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SORCS3Q9UPU3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SORCS3Q9UPU3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SORCS3Q9UPU3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SORCS3Q9UPU3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SORCS3Q9UPU3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SORCS3Q9UPU3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SORCS3Q9UPU3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SORCS3Q9UPU3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SORCS3Q9UPU3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SORCS3Q9UPU3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SORCS3Q9UPU3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SORCS3Q9UPU3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SORCS3Q9UPU3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms