Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP83

COG5, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG5Q9UP83 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COG5Q9UP83 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COG5Q9UP83 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COG5Q9UP83 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
COG5Q9UP83 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
COG5Q9UP83 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
COG5Q9UP83 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
COG5Q9UP83 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
COG5Q9UP83 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
COG5Q9UP83 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COG5Q9UP83 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COG5Q9UP83 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COG5Q9UP83 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
COG5Q9UP83 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
COG5Q9UP83 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
COG5Q9UP83 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COG5Q9UP83 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
COG5Q9UP83 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
COG5Q9UP83 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
COG5Q9UP83 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
COG5Q9UP83 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
COG5Q9UP83 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
COG5Q9UP83 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COG5Q9UP83 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
COG5Q9UP83 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COG5Q9UP83 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
COG5Q9UP83 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
COG5Q9UP83 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COG5Q9UP83 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COG5Q9UP83 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
COG5Q9UP83 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
COG5Q9UP83 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COG5Q9UP83 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
COG5Q9UP83 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
COG5Q9UP83 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
COG5Q9UP83 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
COG5Q9UP83 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
COG5Q9UP83 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
COG5Q9UP83 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COG5Q9UP83 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COG5Q9UP83 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
COG5Q9UP83 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
COG5Q9UP83 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COG5Q9UP83 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
COG5Q9UP83 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
COG5Q9UP83 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
COG5Q9UP83 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
COG5Q9UP83 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COG5Q9UP83 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
COG5Q9UP83 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
COG5Q9UP83 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
COG5Q9UP83 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
COG5Q9UP83 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COG5Q9UP83 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COG5Q9UP83 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COG5Q9UP83 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COG5Q9UP83 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
COG5Q9UP83 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
COG5Q9UP83 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COG5Q9UP83 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
COG5Q9UP83 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
COG5Q9UP83 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
COG5Q9UP83 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
COG5Q9UP83 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
COG5Q9UP83 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
COG5Q9UP83 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
COG5Q9UP83 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
COG5Q9UP83 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COG5Q9UP83 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
COG5Q9UP83 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
COG5Q9UP83 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
COG5Q9UP83 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
COG5Q9UP83 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
COG5Q9UP83 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
COG5Q9UP83 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
COG5Q9UP83 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
COG5Q9UP83 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
COG5Q9UP83 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COG5Q9UP83 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
COG5Q9UP83 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
COG5Q9UP83 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
COG5Q9UP83 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COG5Q9UP83 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COG5Q9UP83 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
COG5Q9UP83 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COG5Q9UP83 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
COG5Q9UP83 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COG5Q9UP83 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
COG5Q9UP83 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COG5Q9UP83 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COG5Q9UP83 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COG5Q9UP83 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
COG5Q9UP83 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COG5Q9UP83 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COG5Q9UP83 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COG5Q9UP83 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COG5Q9UP83 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
COG5Q9UP83 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COG5Q9UP83 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COG5Q9UP83 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms