Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TTF2Q9UNY4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TTF2Q9UNY4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TTF2Q9UNY4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TTF2Q9UNY4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
TTF2Q9UNY4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
TTF2Q9UNY4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TTF2Q9UNY4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TTF2Q9UNY4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
TTF2Q9UNY4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TTF2Q9UNY4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
TTF2Q9UNY4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
TTF2Q9UNY4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TTF2Q9UNY4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TTF2Q9UNY4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
TTF2Q9UNY4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
TTF2Q9UNY4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TTF2Q9UNY4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TTF2Q9UNY4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TTF2Q9UNY4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
TTF2Q9UNY4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TTF2Q9UNY4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TTF2Q9UNY4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TTF2Q9UNY4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TTF2Q9UNY4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TTF2Q9UNY4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TTF2Q9UNY4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
TTF2Q9UNY4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TTF2Q9UNY4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TTF2Q9UNY4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TTF2Q9UNY4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TTF2Q9UNY4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TTF2Q9UNY4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TTF2Q9UNY4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TTF2Q9UNY4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TTF2Q9UNY4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TTF2Q9UNY4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TTF2Q9UNY4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TTF2Q9UNY4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TTF2Q9UNY4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TTF2Q9UNY4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TTF2Q9UNY4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TTF2Q9UNY4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TTF2Q9UNY4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TTF2Q9UNY4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
TTF2Q9UNY4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
TTF2Q9UNY4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
TTF2Q9UNY4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
TTF2Q9UNY4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
TTF2Q9UNY4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
TTF2Q9UNY4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
TTF2Q9UNY4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
TTF2Q9UNY4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
TTF2Q9UNY4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TTF2Q9UNY4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TTF2Q9UNY4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TTF2Q9UNY4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TTF2Q9UNY4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TTF2Q9UNY4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TTF2Q9UNY4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TTF2Q9UNY4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TTF2Q9UNY4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TTF2Q9UNY4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TTF2Q9UNY4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TTF2Q9UNY4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TTF2Q9UNY4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TTF2Q9UNY4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
TTF2Q9UNY4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TTF2Q9UNY4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TTF2Q9UNY4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TTF2Q9UNY4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TTF2Q9UNY4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TTF2Q9UNY4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TTF2Q9UNY4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
TTF2Q9UNY4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
TTF2Q9UNY4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TTF2Q9UNY4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TTF2Q9UNY4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TTF2Q9UNY4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TTF2Q9UNY4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TTF2Q9UNY4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TTF2Q9UNY4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TTF2Q9UNY4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TTF2Q9UNY4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TTF2Q9UNY4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TTF2Q9UNY4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TTF2Q9UNY4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TTF2Q9UNY4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
TTF2Q9UNY4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TTF2Q9UNY4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
TTF2Q9UNY4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TTF2Q9UNY4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TTF2Q9UNY4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TTF2Q9UNY4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TTF2Q9UNY4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TTF2Q9UNY4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TTF2Q9UNY4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TTF2Q9UNY4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TTF2Q9UNY4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
TTF2Q9UNY4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms