Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPS3Q9UNS2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPS3Q9UNS2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPS3Q9UNS2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPS3Q9UNS2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPS3Q9UNS2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPS3Q9UNS2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPS3Q9UNS2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS3Q9UNS2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS3Q9UNS2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS3Q9UNS2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPS3Q9UNS2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPS3Q9UNS2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPS3Q9UNS2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPS3Q9UNS2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPS3Q9UNS2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPS3Q9UNS2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS3Q9UNS2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS3Q9UNS2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS3Q9UNS2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS3Q9UNS2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPS3Q9UNS2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPS3Q9UNS2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPS3Q9UNS2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPS3Q9UNS2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPS3Q9UNS2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPS3Q9UNS2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPS3Q9UNS2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPS3Q9UNS2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPS3Q9UNS2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPS3Q9UNS2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPS3Q9UNS2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPS3Q9UNS2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPS3Q9UNS2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
COPS3Q9UNS2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
COPS3Q9UNS2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPS3Q9UNS2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPS3Q9UNS2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPS3Q9UNS2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPS3Q9UNS2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPS3Q9UNS2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPS3Q9UNS2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPS3Q9UNS2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPS3Q9UNS2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPS3Q9UNS2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPS3Q9UNS2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPS3Q9UNS2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPS3Q9UNS2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPS3Q9UNS2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPS3Q9UNS2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPS3Q9UNS2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPS3Q9UNS2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPS3Q9UNS2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPS3Q9UNS2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPS3Q9UNS2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS3Q9UNS2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS3Q9UNS2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS3Q9UNS2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS3Q9UNS2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS3Q9UNS2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS3Q9UNS2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS3Q9UNS2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS3Q9UNS2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS3Q9UNS2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS3Q9UNS2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS3Q9UNS2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS3Q9UNS2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS3Q9UNS2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS3Q9UNS2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS3Q9UNS2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS3Q9UNS2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS3Q9UNS2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS3Q9UNS2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS3Q9UNS2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS3Q9UNS2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS3Q9UNS2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS3Q9UNS2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPS3Q9UNS2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COPS3Q9UNS2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPS3Q9UNS2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPS3Q9UNS2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COPS3Q9UNS2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPS3Q9UNS2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
COPS3Q9UNS2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COPS3Q9UNS2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPS3Q9UNS2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
COPS3Q9UNS2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COPS3Q9UNS2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPS3Q9UNS2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPS3Q9UNS2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPS3Q9UNS2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPS3Q9UNS2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPS3Q9UNS2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPS3Q9UNS2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPS3Q9UNS2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPS3Q9UNS2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPS3Q9UNS2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPS3Q9UNS2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
COPS3Q9UNS2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPS3Q9UNS2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms