Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF18Q9UNG2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TNFSF18Q9UNG2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFSF18Q9UNG2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFSF18Q9UNG2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TNFSF18Q9UNG2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF18Q9UNG2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TNFSF18Q9UNG2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TNFSF18Q9UNG2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFSF18Q9UNG2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFSF18Q9UNG2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TNFSF18Q9UNG2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TNFSF18Q9UNG2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TNFSF18Q9UNG2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TNFSF18Q9UNG2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TNFSF18Q9UNG2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF18Q9UNG2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF18Q9UNG2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF18Q9UNG2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF18Q9UNG2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF18Q9UNG2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TNFSF18Q9UNG2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF18Q9UNG2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF18Q9UNG2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF18Q9UNG2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF18Q9UNG2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TNFSF18Q9UNG2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNFSF18Q9UNG2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF18Q9UNG2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNFSF18Q9UNG2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF18Q9UNG2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF18Q9UNG2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF18Q9UNG2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF18Q9UNG2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNFSF18Q9UNG2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF18Q9UNG2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNFSF18Q9UNG2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF18Q9UNG2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF18Q9UNG2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNFSF18Q9UNG2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF18Q9UNG2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF18Q9UNG2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF18Q9UNG2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF18Q9UNG2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNFSF18Q9UNG2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF18Q9UNG2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNFSF18Q9UNG2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNFSF18Q9UNG2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TNFSF18Q9UNG2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF18Q9UNG2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF18Q9UNG2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF18Q9UNG2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TNFSF18Q9UNG2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF18Q9UNG2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF18Q9UNG2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF18Q9UNG2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF18Q9UNG2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF18Q9UNG2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF18Q9UNG2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TNFSF18Q9UNG2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF18Q9UNG2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF18Q9UNG2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF18Q9UNG2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF18Q9UNG2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TNFSF18Q9UNG2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF18Q9UNG2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF18Q9UNG2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF18Q9UNG2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF18Q9UNG2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TNFSF18Q9UNG2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF18Q9UNG2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF18Q9UNG2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TNFSF18Q9UNG2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF18Q9UNG2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF18Q9UNG2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TNFSF18Q9UNG2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TNFSF18Q9UNG2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF18Q9UNG2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF18Q9UNG2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TNFSF18Q9UNG2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF18Q9UNG2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF18Q9UNG2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF18Q9UNG2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TNFSF18Q9UNG2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFSF18Q9UNG2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TNFSF18Q9UNG2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TNFSF18Q9UNG2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF18Q9UNG2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF18Q9UNG2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF18Q9UNG2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF18Q9UNG2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF18Q9UNG2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TNFSF18Q9UNG2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF18Q9UNG2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF18Q9UNG2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF18Q9UNG2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF18Q9UNG2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF18Q9UNG2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF18Q9UNG2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms