Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT8

HECTD1, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD1, humanhuman

Predictions only

Length 2,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD1Q9ULT8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HECTD1Q9ULT8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HECTD1Q9ULT8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HECTD1Q9ULT8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HECTD1Q9ULT8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HECTD1Q9ULT8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HECTD1Q9ULT8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HECTD1Q9ULT8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HECTD1Q9ULT8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HECTD1Q9ULT8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HECTD1Q9ULT8 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HECTD1Q9ULT8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HECTD1Q9ULT8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HECTD1Q9ULT8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HECTD1Q9ULT8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECTD1Q9ULT8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECTD1Q9ULT8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECTD1Q9ULT8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECTD1Q9ULT8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECTD1Q9ULT8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HECTD1Q9ULT8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HECTD1Q9ULT8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HECTD1Q9ULT8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HECTD1Q9ULT8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HECTD1Q9ULT8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HECTD1Q9ULT8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HECTD1Q9ULT8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HECTD1Q9ULT8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HECTD1Q9ULT8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HECTD1Q9ULT8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HECTD1Q9ULT8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HECTD1Q9ULT8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HECTD1Q9ULT8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HECTD1Q9ULT8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HECTD1Q9ULT8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HECTD1Q9ULT8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HECTD1Q9ULT8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HECTD1Q9ULT8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HECTD1Q9ULT8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HECTD1Q9ULT8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECTD1Q9ULT8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECTD1Q9ULT8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECTD1Q9ULT8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECTD1Q9ULT8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECTD1Q9ULT8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECTD1Q9ULT8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECTD1Q9ULT8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HECTD1Q9ULT8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECTD1Q9ULT8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HECTD1Q9ULT8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HECTD1Q9ULT8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HECTD1Q9ULT8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HECTD1Q9ULT8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HECTD1Q9ULT8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HECTD1Q9ULT8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HECTD1Q9ULT8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HECTD1Q9ULT8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HECTD1Q9ULT8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HECTD1Q9ULT8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HECTD1Q9ULT8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HECTD1Q9ULT8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HECTD1Q9ULT8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HECTD1Q9ULT8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HECTD1Q9ULT8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HECTD1Q9ULT8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HECTD1Q9ULT8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HECTD1Q9ULT8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HECTD1Q9ULT8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HECTD1Q9ULT8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HECTD1Q9ULT8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECTD1Q9ULT8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HECTD1Q9ULT8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HECTD1Q9ULT8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HECTD1Q9ULT8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HECTD1Q9ULT8 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HECTD1Q9ULT8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HECTD1Q9ULT8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HECTD1Q9ULT8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HECTD1Q9ULT8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HECTD1Q9ULT8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HECTD1Q9ULT8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HECTD1Q9ULT8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HECTD1Q9ULT8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HECTD1Q9ULT8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HECTD1Q9ULT8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HECTD1Q9ULT8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HECTD1Q9ULT8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HECTD1Q9ULT8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HECTD1Q9ULT8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HECTD1Q9ULT8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HECTD1Q9ULT8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HECTD1Q9ULT8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HECTD1Q9ULT8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HECTD1Q9ULT8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HECTD1Q9ULT8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HECTD1Q9ULT8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HECTD1Q9ULT8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HECTD1Q9ULT8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HECTD1Q9ULT8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HECTD1Q9ULT8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms