Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CNOT6Q9ULM6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CNOT6Q9ULM6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNOT6Q9ULM6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNOT6Q9ULM6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CNOT6Q9ULM6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNOT6Q9ULM6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNOT6Q9ULM6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNOT6Q9ULM6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNOT6Q9ULM6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CNOT6Q9ULM6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNOT6Q9ULM6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNOT6Q9ULM6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNOT6Q9ULM6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNOT6Q9ULM6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CNOT6Q9ULM6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNOT6Q9ULM6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CNOT6Q9ULM6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CNOT6Q9ULM6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CNOT6Q9ULM6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNOT6Q9ULM6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNOT6Q9ULM6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNOT6Q9ULM6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNOT6Q9ULM6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNOT6Q9ULM6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNOT6Q9ULM6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNOT6Q9ULM6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CNOT6Q9ULM6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNOT6Q9ULM6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNOT6Q9ULM6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNOT6Q9ULM6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNOT6Q9ULM6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNOT6Q9ULM6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNOT6Q9ULM6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNOT6Q9ULM6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNOT6Q9ULM6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNOT6Q9ULM6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNOT6Q9ULM6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNOT6Q9ULM6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CNOT6Q9ULM6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNOT6Q9ULM6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNOT6Q9ULM6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNOT6Q9ULM6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNOT6Q9ULM6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNOT6Q9ULM6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNOT6Q9ULM6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CNOT6Q9ULM6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CNOT6Q9ULM6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNOT6Q9ULM6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNOT6Q9ULM6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNOT6Q9ULM6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNOT6Q9ULM6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CNOT6Q9ULM6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CNOT6Q9ULM6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNOT6Q9ULM6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNOT6Q9ULM6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNOT6Q9ULM6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNOT6Q9ULM6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNOT6Q9ULM6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNOT6Q9ULM6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNOT6Q9ULM6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNOT6Q9ULM6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNOT6Q9ULM6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNOT6Q9ULM6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNOT6Q9ULM6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNOT6Q9ULM6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNOT6Q9ULM6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNOT6Q9ULM6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNOT6Q9ULM6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNOT6Q9ULM6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNOT6Q9ULM6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNOT6Q9ULM6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNOT6Q9ULM6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNOT6Q9ULM6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNOT6Q9ULM6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNOT6Q9ULM6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNOT6Q9ULM6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNOT6Q9ULM6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNOT6Q9ULM6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNOT6Q9ULM6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNOT6Q9ULM6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNOT6Q9ULM6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNOT6Q9ULM6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNOT6Q9ULM6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNOT6Q9ULM6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNOT6Q9ULM6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNOT6Q9ULM6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CNOT6Q9ULM6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CNOT6Q9ULM6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNOT6Q9ULM6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNOT6Q9ULM6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNOT6Q9ULM6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNOT6Q9ULM6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNOT6Q9ULM6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CNOT6Q9ULM6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNOT6Q9ULM6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CNOT6Q9ULM6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNOT6Q9ULM6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNOT6Q9ULM6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNOT6Q9ULM6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms