Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC4

MCTS1, Malignant T-cell-amplified sequence 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTS1Q9ULC4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCTS1Q9ULC4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCTS1Q9ULC4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCTS1Q9ULC4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCTS1Q9ULC4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCTS1Q9ULC4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCTS1Q9ULC4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCTS1Q9ULC4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCTS1Q9ULC4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCTS1Q9ULC4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCTS1Q9ULC4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCTS1Q9ULC4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCTS1Q9ULC4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCTS1Q9ULC4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCTS1Q9ULC4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCTS1Q9ULC4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MCTS1Q9ULC4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCTS1Q9ULC4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCTS1Q9ULC4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCTS1Q9ULC4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCTS1Q9ULC4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCTS1Q9ULC4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCTS1Q9ULC4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCTS1Q9ULC4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCTS1Q9ULC4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCTS1Q9ULC4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MCTS1Q9ULC4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCTS1Q9ULC4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MCTS1Q9ULC4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCTS1Q9ULC4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCTS1Q9ULC4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCTS1Q9ULC4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCTS1Q9ULC4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCTS1Q9ULC4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCTS1Q9ULC4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCTS1Q9ULC4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCTS1Q9ULC4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCTS1Q9ULC4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCTS1Q9ULC4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCTS1Q9ULC4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCTS1Q9ULC4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCTS1Q9ULC4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCTS1Q9ULC4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCTS1Q9ULC4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCTS1Q9ULC4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCTS1Q9ULC4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCTS1Q9ULC4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCTS1Q9ULC4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MCTS1Q9ULC4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCTS1Q9ULC4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCTS1Q9ULC4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MCTS1Q9ULC4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCTS1Q9ULC4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCTS1Q9ULC4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCTS1Q9ULC4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCTS1Q9ULC4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCTS1Q9ULC4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCTS1Q9ULC4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCTS1Q9ULC4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCTS1Q9ULC4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCTS1Q9ULC4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCTS1Q9ULC4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MCTS1Q9ULC4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCTS1Q9ULC4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCTS1Q9ULC4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCTS1Q9ULC4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MCTS1Q9ULC4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MCTS1Q9ULC4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCTS1Q9ULC4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MCTS1Q9ULC4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCTS1Q9ULC4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCTS1Q9ULC4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCTS1Q9ULC4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCTS1Q9ULC4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCTS1Q9ULC4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCTS1Q9ULC4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCTS1Q9ULC4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCTS1Q9ULC4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCTS1Q9ULC4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCTS1Q9ULC4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCTS1Q9ULC4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCTS1Q9ULC4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MCTS1Q9ULC4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCTS1Q9ULC4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCTS1Q9ULC4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCTS1Q9ULC4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCTS1Q9ULC4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCTS1Q9ULC4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCTS1Q9ULC4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCTS1Q9ULC4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCTS1Q9ULC4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCTS1Q9ULC4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MCTS1Q9ULC4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCTS1Q9ULC4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCTS1Q9ULC4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCTS1Q9ULC4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCTS1Q9ULC4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCTS1Q9ULC4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCTS1Q9ULC4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCTS1Q9ULC4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms