Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VAX2Q9UIW0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VAX2Q9UIW0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VAX2Q9UIW0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VAX2Q9UIW0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VAX2Q9UIW0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAX2Q9UIW0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAX2Q9UIW0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAX2Q9UIW0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAX2Q9UIW0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAX2Q9UIW0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAX2Q9UIW0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAX2Q9UIW0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAX2Q9UIW0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAX2Q9UIW0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAX2Q9UIW0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAX2Q9UIW0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAX2Q9UIW0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAX2Q9UIW0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAX2Q9UIW0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VAX2Q9UIW0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VAX2Q9UIW0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAX2Q9UIW0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VAX2Q9UIW0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VAX2Q9UIW0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAX2Q9UIW0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
VAX2Q9UIW0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAX2Q9UIW0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAX2Q9UIW0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAX2Q9UIW0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAX2Q9UIW0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VAX2Q9UIW0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VAX2Q9UIW0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAX2Q9UIW0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAX2Q9UIW0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VAX2Q9UIW0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VAX2Q9UIW0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAX2Q9UIW0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAX2Q9UIW0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VAX2Q9UIW0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VAX2Q9UIW0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAX2Q9UIW0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAX2Q9UIW0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAX2Q9UIW0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAX2Q9UIW0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VAX2Q9UIW0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAX2Q9UIW0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAX2Q9UIW0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAX2Q9UIW0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAX2Q9UIW0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VAX2Q9UIW0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VAX2Q9UIW0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAX2Q9UIW0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAX2Q9UIW0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAX2Q9UIW0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VAX2Q9UIW0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAX2Q9UIW0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VAX2Q9UIW0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAX2Q9UIW0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAX2Q9UIW0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAX2Q9UIW0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAX2Q9UIW0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAX2Q9UIW0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VAX2Q9UIW0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAX2Q9UIW0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAX2Q9UIW0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VAX2Q9UIW0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAX2Q9UIW0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VAX2Q9UIW0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAX2Q9UIW0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAX2Q9UIW0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAX2Q9UIW0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VAX2Q9UIW0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
VAX2Q9UIW0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
VAX2Q9UIW0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
VAX2Q9UIW0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAX2Q9UIW0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
VAX2Q9UIW0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAX2Q9UIW0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VAX2Q9UIW0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAX2Q9UIW0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAX2Q9UIW0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAX2Q9UIW0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAX2Q9UIW0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VAX2Q9UIW0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAX2Q9UIW0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VAX2Q9UIW0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAX2Q9UIW0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAX2Q9UIW0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VAX2Q9UIW0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAX2Q9UIW0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAX2Q9UIW0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAX2Q9UIW0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAX2Q9UIW0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
VAX2Q9UIW0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAX2Q9UIW0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAX2Q9UIW0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VAX2Q9UIW0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VAX2Q9UIW0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VAX2Q9UIW0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms