Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ6

SHPK, Sedoheptulokinase, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPKQ9UHJ6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHPKQ9UHJ6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHPKQ9UHJ6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHPKQ9UHJ6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SHPKQ9UHJ6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHPKQ9UHJ6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHPKQ9UHJ6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SHPKQ9UHJ6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHPKQ9UHJ6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHPKQ9UHJ6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHPKQ9UHJ6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHPKQ9UHJ6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHPKQ9UHJ6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHPKQ9UHJ6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SHPKQ9UHJ6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SHPKQ9UHJ6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SHPKQ9UHJ6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHPKQ9UHJ6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHPKQ9UHJ6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHPKQ9UHJ6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHPKQ9UHJ6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHPKQ9UHJ6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHPKQ9UHJ6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHPKQ9UHJ6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHPKQ9UHJ6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHPKQ9UHJ6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHPKQ9UHJ6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHPKQ9UHJ6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHPKQ9UHJ6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHPKQ9UHJ6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHPKQ9UHJ6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHPKQ9UHJ6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHPKQ9UHJ6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHPKQ9UHJ6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHPKQ9UHJ6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHPKQ9UHJ6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHPKQ9UHJ6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHPKQ9UHJ6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHPKQ9UHJ6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SHPKQ9UHJ6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHPKQ9UHJ6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHPKQ9UHJ6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHPKQ9UHJ6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHPKQ9UHJ6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHPKQ9UHJ6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHPKQ9UHJ6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHPKQ9UHJ6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHPKQ9UHJ6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHPKQ9UHJ6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHPKQ9UHJ6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHPKQ9UHJ6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHPKQ9UHJ6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHPKQ9UHJ6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPKQ9UHJ6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPKQ9UHJ6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHPKQ9UHJ6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHPKQ9UHJ6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHPKQ9UHJ6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHPKQ9UHJ6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHPKQ9UHJ6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SHPKQ9UHJ6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHPKQ9UHJ6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHPKQ9UHJ6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHPKQ9UHJ6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHPKQ9UHJ6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPKQ9UHJ6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPKQ9UHJ6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPKQ9UHJ6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHPKQ9UHJ6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHPKQ9UHJ6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHPKQ9UHJ6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHPKQ9UHJ6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHPKQ9UHJ6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPKQ9UHJ6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPKQ9UHJ6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHPKQ9UHJ6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPKQ9UHJ6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPKQ9UHJ6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPKQ9UHJ6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHPKQ9UHJ6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHPKQ9UHJ6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHPKQ9UHJ6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHPKQ9UHJ6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHPKQ9UHJ6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SHPKQ9UHJ6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHPKQ9UHJ6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHPKQ9UHJ6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHPKQ9UHJ6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SHPKQ9UHJ6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SHPKQ9UHJ6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHPKQ9UHJ6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SHPKQ9UHJ6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHPKQ9UHJ6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHPKQ9UHJ6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHPKQ9UHJ6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHPKQ9UHJ6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SHPKQ9UHJ6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPKQ9UHJ6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPKQ9UHJ6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SHPKQ9UHJ6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms