Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNTNAP2Q9UHC6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNTNAP2Q9UHC6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNTNAP2Q9UHC6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNTNAP2Q9UHC6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNTNAP2Q9UHC6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNTNAP2Q9UHC6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNTNAP2Q9UHC6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNTNAP2Q9UHC6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNTNAP2Q9UHC6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNTNAP2Q9UHC6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNTNAP2Q9UHC6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CNTNAP2Q9UHC6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CNTNAP2Q9UHC6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CNTNAP2Q9UHC6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNTNAP2Q9UHC6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNTNAP2Q9UHC6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNTNAP2Q9UHC6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNTNAP2Q9UHC6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNTNAP2Q9UHC6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNTNAP2Q9UHC6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNTNAP2Q9UHC6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNTNAP2Q9UHC6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNTNAP2Q9UHC6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNTNAP2Q9UHC6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNTNAP2Q9UHC6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNTNAP2Q9UHC6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNTNAP2Q9UHC6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNTNAP2Q9UHC6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNTNAP2Q9UHC6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNTNAP2Q9UHC6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNTNAP2Q9UHC6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNTNAP2Q9UHC6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CNTNAP2Q9UHC6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNTNAP2Q9UHC6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CNTNAP2Q9UHC6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNTNAP2Q9UHC6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNTNAP2Q9UHC6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNTNAP2Q9UHC6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNTNAP2Q9UHC6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNTNAP2Q9UHC6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNTNAP2Q9UHC6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNTNAP2Q9UHC6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CNTNAP2Q9UHC6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CNTNAP2Q9UHC6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNTNAP2Q9UHC6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CNTNAP2Q9UHC6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNTNAP2Q9UHC6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNTNAP2Q9UHC6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CNTNAP2Q9UHC6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CNTNAP2Q9UHC6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CNTNAP2Q9UHC6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CNTNAP2Q9UHC6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNTNAP2Q9UHC6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CNTNAP2Q9UHC6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CNTNAP2Q9UHC6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CNTNAP2Q9UHC6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CNTNAP2Q9UHC6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CNTNAP2Q9UHC6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CNTNAP2Q9UHC6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNTNAP2Q9UHC6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNTNAP2Q9UHC6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNTNAP2Q9UHC6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNTNAP2Q9UHC6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNTNAP2Q9UHC6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNTNAP2Q9UHC6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNTNAP2Q9UHC6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CNTNAP2Q9UHC6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNTNAP2Q9UHC6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNTNAP2Q9UHC6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CNTNAP2Q9UHC6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CNTNAP2Q9UHC6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CNTNAP2Q9UHC6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNTNAP2Q9UHC6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNTNAP2Q9UHC6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNTNAP2Q9UHC6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNTNAP2Q9UHC6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNTNAP2Q9UHC6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNTNAP2Q9UHC6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNTNAP2Q9UHC6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CNTNAP2Q9UHC6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNTNAP2Q9UHC6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CNTNAP2Q9UHC6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CNTNAP2Q9UHC6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CNTNAP2Q9UHC6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNTNAP2Q9UHC6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNTNAP2Q9UHC6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNTNAP2Q9UHC6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNTNAP2Q9UHC6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNTNAP2Q9UHC6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNTNAP2Q9UHC6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNTNAP2Q9UHC6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CNTNAP2Q9UHC6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTNAP2Q9UHC6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTNAP2Q9UHC6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTNAP2Q9UHC6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTNAP2Q9UHC6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.3 ms