Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CHPF2Q9P2E5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CHPF2Q9P2E5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CHPF2Q9P2E5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CHPF2Q9P2E5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHPF2Q9P2E5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHPF2Q9P2E5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHPF2Q9P2E5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CHPF2Q9P2E5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CHPF2Q9P2E5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CHPF2Q9P2E5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
CHPF2Q9P2E5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CHPF2Q9P2E5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CHPF2Q9P2E5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CHPF2Q9P2E5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CHPF2Q9P2E5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CHPF2Q9P2E5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CHPF2Q9P2E5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
CHPF2Q9P2E5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CHPF2Q9P2E5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CHPF2Q9P2E5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CHPF2Q9P2E5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHPF2Q9P2E5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHPF2Q9P2E5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHPF2Q9P2E5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHPF2Q9P2E5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
CHPF2Q9P2E5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CHPF2Q9P2E5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CHPF2Q9P2E5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CHPF2Q9P2E5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CHPF2Q9P2E5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CHPF2Q9P2E5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CHPF2Q9P2E5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CHPF2Q9P2E5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CHPF2Q9P2E5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CHPF2Q9P2E5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CHPF2Q9P2E5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CHPF2Q9P2E5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CHPF2Q9P2E5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CHPF2Q9P2E5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CHPF2Q9P2E5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CHPF2Q9P2E5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CHPF2Q9P2E5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CHPF2Q9P2E5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHPF2Q9P2E5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CHPF2Q9P2E5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CHPF2Q9P2E5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CHPF2Q9P2E5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHPF2Q9P2E5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CHPF2Q9P2E5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
CHPF2Q9P2E5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
CHPF2Q9P2E5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHPF2Q9P2E5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHPF2Q9P2E5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CHPF2Q9P2E5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CHPF2Q9P2E5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
CHPF2Q9P2E5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CHPF2Q9P2E5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CHPF2Q9P2E5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CHPF2Q9P2E5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CHPF2Q9P2E5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CHPF2Q9P2E5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
CHPF2Q9P2E5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
CHPF2Q9P2E5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
CHPF2Q9P2E5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CHPF2Q9P2E5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CHPF2Q9P2E5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CHPF2Q9P2E5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CHPF2Q9P2E5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CHPF2Q9P2E5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CHPF2Q9P2E5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CHPF2Q9P2E5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CHPF2Q9P2E5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CHPF2Q9P2E5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CHPF2Q9P2E5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CHPF2Q9P2E5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CHPF2Q9P2E5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CHPF2Q9P2E5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CHPF2Q9P2E5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CHPF2Q9P2E5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CHPF2Q9P2E5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CHPF2Q9P2E5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CHPF2Q9P2E5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
CHPF2Q9P2E5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
CHPF2Q9P2E5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CHPF2Q9P2E5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CHPF2Q9P2E5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
CHPF2Q9P2E5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CHPF2Q9P2E5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CHPF2Q9P2E5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CHPF2Q9P2E5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CHPF2Q9P2E5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CHPF2Q9P2E5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CHPF2Q9P2E5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CHPF2Q9P2E5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CHPF2Q9P2E5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
CHPF2Q9P2E5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CHPF2Q9P2E5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CHPF2Q9P2E5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CHPF2Q9P2E5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms