Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SCHIP1Q9P0W5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SCHIP1Q9P0W5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCHIP1Q9P0W5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCHIP1Q9P0W5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SCHIP1Q9P0W5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCHIP1Q9P0W5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCHIP1Q9P0W5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCHIP1Q9P0W5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SCHIP1Q9P0W5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCHIP1Q9P0W5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCHIP1Q9P0W5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCHIP1Q9P0W5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCHIP1Q9P0W5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SCHIP1Q9P0W5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCHIP1Q9P0W5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SCHIP1Q9P0W5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCHIP1Q9P0W5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCHIP1Q9P0W5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCHIP1Q9P0W5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCHIP1Q9P0W5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SCHIP1Q9P0W5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SCHIP1Q9P0W5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCHIP1Q9P0W5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCHIP1Q9P0W5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCHIP1Q9P0W5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SCHIP1Q9P0W5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SCHIP1Q9P0W5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SCHIP1Q9P0W5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCHIP1Q9P0W5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCHIP1Q9P0W5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SCHIP1Q9P0W5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCHIP1Q9P0W5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCHIP1Q9P0W5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCHIP1Q9P0W5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCHIP1Q9P0W5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCHIP1Q9P0W5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCHIP1Q9P0W5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SCHIP1Q9P0W5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SCHIP1Q9P0W5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCHIP1Q9P0W5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SCHIP1Q9P0W5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SCHIP1Q9P0W5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCHIP1Q9P0W5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCHIP1Q9P0W5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCHIP1Q9P0W5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCHIP1Q9P0W5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SCHIP1Q9P0W5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCHIP1Q9P0W5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCHIP1Q9P0W5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCHIP1Q9P0W5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SCHIP1Q9P0W5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCHIP1Q9P0W5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCHIP1Q9P0W5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCHIP1Q9P0W5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SCHIP1Q9P0W5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCHIP1Q9P0W5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCHIP1Q9P0W5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCHIP1Q9P0W5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SCHIP1Q9P0W5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCHIP1Q9P0W5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCHIP1Q9P0W5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCHIP1Q9P0W5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCHIP1Q9P0W5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCHIP1Q9P0W5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SCHIP1Q9P0W5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCHIP1Q9P0W5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCHIP1Q9P0W5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCHIP1Q9P0W5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCHIP1Q9P0W5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCHIP1Q9P0W5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCHIP1Q9P0W5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCHIP1Q9P0W5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCHIP1Q9P0W5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SCHIP1Q9P0W5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCHIP1Q9P0W5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCHIP1Q9P0W5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCHIP1Q9P0W5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCHIP1Q9P0W5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCHIP1Q9P0W5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCHIP1Q9P0W5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCHIP1Q9P0W5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCHIP1Q9P0W5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCHIP1Q9P0W5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCHIP1Q9P0W5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCHIP1Q9P0W5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCHIP1Q9P0W5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCHIP1Q9P0W5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCHIP1Q9P0W5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCHIP1Q9P0W5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCHIP1Q9P0W5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCHIP1Q9P0W5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCHIP1Q9P0W5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCHIP1Q9P0W5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCHIP1Q9P0W5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCHIP1Q9P0W5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCHIP1Q9P0W5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCHIP1Q9P0W5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms