Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0N8

MARCH2, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH2, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH2Q9P0N8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MARCH2Q9P0N8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MARCH2Q9P0N8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MARCH2Q9P0N8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MARCH2Q9P0N8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MARCH2Q9P0N8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MARCH2Q9P0N8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MARCH2Q9P0N8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MARCH2Q9P0N8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MARCH2Q9P0N8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MARCH2Q9P0N8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MARCH2Q9P0N8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MARCH2Q9P0N8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MARCH2Q9P0N8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MARCH2Q9P0N8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MARCH2Q9P0N8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MARCH2Q9P0N8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MARCH2Q9P0N8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
MARCH2Q9P0N8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MARCH2Q9P0N8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
MARCH2Q9P0N8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MARCH2Q9P0N8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MARCH2Q9P0N8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MARCH2Q9P0N8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MARCH2Q9P0N8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MARCH2Q9P0N8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MARCH2Q9P0N8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MARCH2Q9P0N8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MARCH2Q9P0N8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MARCH2Q9P0N8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MARCH2Q9P0N8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MARCH2Q9P0N8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MARCH2Q9P0N8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MARCH2Q9P0N8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MARCH2Q9P0N8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MARCH2Q9P0N8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MARCH2Q9P0N8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
MARCH2Q9P0N8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MARCH2Q9P0N8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MARCH2Q9P0N8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MARCH2Q9P0N8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MARCH2Q9P0N8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MARCH2Q9P0N8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MARCH2Q9P0N8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MARCH2Q9P0N8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MARCH2Q9P0N8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MARCH2Q9P0N8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MARCH2Q9P0N8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MARCH2Q9P0N8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MARCH2Q9P0N8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MARCH2Q9P0N8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MARCH2Q9P0N8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MARCH2Q9P0N8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MARCH2Q9P0N8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
MARCH2Q9P0N8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MARCH2Q9P0N8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MARCH2Q9P0N8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MARCH2Q9P0N8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MARCH2Q9P0N8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MARCH2Q9P0N8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MARCH2Q9P0N8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MARCH2Q9P0N8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MARCH2Q9P0N8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MARCH2Q9P0N8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MARCH2Q9P0N8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MARCH2Q9P0N8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MARCH2Q9P0N8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MARCH2Q9P0N8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MARCH2Q9P0N8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MARCH2Q9P0N8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MARCH2Q9P0N8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MARCH2Q9P0N8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MARCH2Q9P0N8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MARCH2Q9P0N8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MARCH2Q9P0N8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MARCH2Q9P0N8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MARCH2Q9P0N8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MARCH2Q9P0N8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MARCH2Q9P0N8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MARCH2Q9P0N8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MARCH2Q9P0N8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MARCH2Q9P0N8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MARCH2Q9P0N8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MARCH2Q9P0N8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MARCH2Q9P0N8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MARCH2Q9P0N8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MARCH2Q9P0N8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MARCH2Q9P0N8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MARCH2Q9P0N8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MARCH2Q9P0N8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MARCH2Q9P0N8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MARCH2Q9P0N8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MARCH2Q9P0N8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MARCH2Q9P0N8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MARCH2Q9P0N8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MARCH2Q9P0N8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MARCH2Q9P0N8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MARCH2Q9P0N8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MARCH2Q9P0N8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MARCH2Q9P0N8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms