Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN8

CNOT2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT2Q9NZN8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNOT2Q9NZN8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CNOT2Q9NZN8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CNOT2Q9NZN8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CNOT2Q9NZN8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNOT2Q9NZN8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNOT2Q9NZN8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNOT2Q9NZN8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CNOT2Q9NZN8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CNOT2Q9NZN8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CNOT2Q9NZN8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT2Q9NZN8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT2Q9NZN8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CNOT2Q9NZN8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CNOT2Q9NZN8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT2Q9NZN8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT2Q9NZN8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT2Q9NZN8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT2Q9NZN8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CNOT2Q9NZN8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT2Q9NZN8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CNOT2Q9NZN8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT2Q9NZN8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT2Q9NZN8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT2Q9NZN8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CNOT2Q9NZN8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNOT2Q9NZN8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNOT2Q9NZN8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CNOT2Q9NZN8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CNOT2Q9NZN8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT2Q9NZN8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNOT2Q9NZN8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT2Q9NZN8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT2Q9NZN8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNOT2Q9NZN8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT2Q9NZN8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT2Q9NZN8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNOT2Q9NZN8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNOT2Q9NZN8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNOT2Q9NZN8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNOT2Q9NZN8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNOT2Q9NZN8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT2Q9NZN8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT2Q9NZN8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNOT2Q9NZN8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT2Q9NZN8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT2Q9NZN8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT2Q9NZN8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT2Q9NZN8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT2Q9NZN8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNOT2Q9NZN8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT2Q9NZN8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT2Q9NZN8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNOT2Q9NZN8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT2Q9NZN8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT2Q9NZN8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNOT2Q9NZN8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT2Q9NZN8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT2Q9NZN8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNOT2Q9NZN8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT2Q9NZN8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT2Q9NZN8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT2Q9NZN8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT2Q9NZN8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNOT2Q9NZN8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT2Q9NZN8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT2Q9NZN8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CNOT2Q9NZN8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT2Q9NZN8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNOT2Q9NZN8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT2Q9NZN8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT2Q9NZN8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT2Q9NZN8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNOT2Q9NZN8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT2Q9NZN8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT2Q9NZN8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT2Q9NZN8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT2Q9NZN8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNOT2Q9NZN8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT2Q9NZN8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNOT2Q9NZN8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT2Q9NZN8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT2Q9NZN8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT2Q9NZN8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT2Q9NZN8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT2Q9NZN8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT2Q9NZN8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNOT2Q9NZN8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT2Q9NZN8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT2Q9NZN8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT2Q9NZN8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT2Q9NZN8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT2Q9NZN8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT2Q9NZN8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT2Q9NZN8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNOT2Q9NZN8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNOT2Q9NZN8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNOT2Q9NZN8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT2Q9NZN8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNOT2Q9NZN8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms