Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GDAP2Q9NXN4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GDAP2Q9NXN4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GDAP2Q9NXN4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GDAP2Q9NXN4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GDAP2Q9NXN4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GDAP2Q9NXN4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GDAP2Q9NXN4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GDAP2Q9NXN4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GDAP2Q9NXN4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GDAP2Q9NXN4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GDAP2Q9NXN4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GDAP2Q9NXN4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GDAP2Q9NXN4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GDAP2Q9NXN4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
GDAP2Q9NXN4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GDAP2Q9NXN4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GDAP2Q9NXN4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GDAP2Q9NXN4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
GDAP2Q9NXN4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GDAP2Q9NXN4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GDAP2Q9NXN4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GDAP2Q9NXN4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GDAP2Q9NXN4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GDAP2Q9NXN4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GDAP2Q9NXN4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GDAP2Q9NXN4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
GDAP2Q9NXN4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GDAP2Q9NXN4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GDAP2Q9NXN4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GDAP2Q9NXN4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GDAP2Q9NXN4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GDAP2Q9NXN4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GDAP2Q9NXN4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GDAP2Q9NXN4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GDAP2Q9NXN4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
GDAP2Q9NXN4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GDAP2Q9NXN4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GDAP2Q9NXN4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GDAP2Q9NXN4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GDAP2Q9NXN4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GDAP2Q9NXN4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GDAP2Q9NXN4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GDAP2Q9NXN4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GDAP2Q9NXN4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GDAP2Q9NXN4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GDAP2Q9NXN4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GDAP2Q9NXN4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GDAP2Q9NXN4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GDAP2Q9NXN4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GDAP2Q9NXN4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GDAP2Q9NXN4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GDAP2Q9NXN4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
GDAP2Q9NXN4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GDAP2Q9NXN4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GDAP2Q9NXN4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GDAP2Q9NXN4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GDAP2Q9NXN4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GDAP2Q9NXN4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GDAP2Q9NXN4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GDAP2Q9NXN4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GDAP2Q9NXN4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GDAP2Q9NXN4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GDAP2Q9NXN4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GDAP2Q9NXN4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GDAP2Q9NXN4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GDAP2Q9NXN4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GDAP2Q9NXN4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GDAP2Q9NXN4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GDAP2Q9NXN4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GDAP2Q9NXN4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GDAP2Q9NXN4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GDAP2Q9NXN4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GDAP2Q9NXN4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GDAP2Q9NXN4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GDAP2Q9NXN4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GDAP2Q9NXN4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GDAP2Q9NXN4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GDAP2Q9NXN4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GDAP2Q9NXN4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GDAP2Q9NXN4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GDAP2Q9NXN4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GDAP2Q9NXN4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GDAP2Q9NXN4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GDAP2Q9NXN4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GDAP2Q9NXN4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GDAP2Q9NXN4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
GDAP2Q9NXN4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GDAP2Q9NXN4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GDAP2Q9NXN4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GDAP2Q9NXN4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GDAP2Q9NXN4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GDAP2Q9NXN4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GDAP2Q9NXN4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GDAP2Q9NXN4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GDAP2Q9NXN4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GDAP2Q9NXN4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GDAP2Q9NXN4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GDAP2Q9NXN4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GDAP2Q9NXN4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms