Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MS4A12Q9NXJ0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MS4A12Q9NXJ0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MS4A12Q9NXJ0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MS4A12Q9NXJ0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MS4A12Q9NXJ0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A12Q9NXJ0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A12Q9NXJ0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A12Q9NXJ0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A12Q9NXJ0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A12Q9NXJ0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A12Q9NXJ0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A12Q9NXJ0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A12Q9NXJ0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A12Q9NXJ0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A12Q9NXJ0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A12Q9NXJ0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A12Q9NXJ0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A12Q9NXJ0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A12Q9NXJ0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A12Q9NXJ0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A12Q9NXJ0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A12Q9NXJ0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MS4A12Q9NXJ0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MS4A12Q9NXJ0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MS4A12Q9NXJ0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MS4A12Q9NXJ0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MS4A12Q9NXJ0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MS4A12Q9NXJ0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A12Q9NXJ0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A12Q9NXJ0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A12Q9NXJ0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A12Q9NXJ0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MS4A12Q9NXJ0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MS4A12Q9NXJ0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MS4A12Q9NXJ0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MS4A12Q9NXJ0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MS4A12Q9NXJ0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A12Q9NXJ0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A12Q9NXJ0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MS4A12Q9NXJ0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MS4A12Q9NXJ0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A12Q9NXJ0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A12Q9NXJ0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A12Q9NXJ0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MS4A12Q9NXJ0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A12Q9NXJ0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MS4A12Q9NXJ0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A12Q9NXJ0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A12Q9NXJ0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A12Q9NXJ0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A12Q9NXJ0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MS4A12Q9NXJ0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A12Q9NXJ0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A12Q9NXJ0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A12Q9NXJ0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A12Q9NXJ0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MS4A12Q9NXJ0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A12Q9NXJ0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A12Q9NXJ0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MS4A12Q9NXJ0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MS4A12Q9NXJ0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A12Q9NXJ0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MS4A12Q9NXJ0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A12Q9NXJ0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MS4A12Q9NXJ0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A12Q9NXJ0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A12Q9NXJ0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A12Q9NXJ0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MS4A12Q9NXJ0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A12Q9NXJ0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A12Q9NXJ0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MS4A12Q9NXJ0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A12Q9NXJ0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A12Q9NXJ0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A12Q9NXJ0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MS4A12Q9NXJ0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A12Q9NXJ0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A12Q9NXJ0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MS4A12Q9NXJ0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MS4A12Q9NXJ0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A12Q9NXJ0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MS4A12Q9NXJ0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MS4A12Q9NXJ0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A12Q9NXJ0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A12Q9NXJ0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MS4A12Q9NXJ0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A12Q9NXJ0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A12Q9NXJ0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MS4A12Q9NXJ0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A12Q9NXJ0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A12Q9NXJ0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A12Q9NXJ0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A12Q9NXJ0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A12Q9NXJ0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A12Q9NXJ0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A12Q9NXJ0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A12Q9NXJ0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MS4A12Q9NXJ0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MS4A12Q9NXJ0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms