Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD9

BEX4, Protein BEX4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX4Q9NWD9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEX4Q9NWD9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEX4Q9NWD9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BEX4Q9NWD9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEX4Q9NWD9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEX4Q9NWD9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEX4Q9NWD9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEX4Q9NWD9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BEX4Q9NWD9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BEX4Q9NWD9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEX4Q9NWD9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEX4Q9NWD9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEX4Q9NWD9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEX4Q9NWD9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEX4Q9NWD9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEX4Q9NWD9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEX4Q9NWD9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEX4Q9NWD9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BEX4Q9NWD9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEX4Q9NWD9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BEX4Q9NWD9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEX4Q9NWD9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BEX4Q9NWD9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEX4Q9NWD9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEX4Q9NWD9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEX4Q9NWD9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEX4Q9NWD9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BEX4Q9NWD9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BEX4Q9NWD9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BEX4Q9NWD9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEX4Q9NWD9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEX4Q9NWD9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEX4Q9NWD9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEX4Q9NWD9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEX4Q9NWD9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEX4Q9NWD9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEX4Q9NWD9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEX4Q9NWD9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEX4Q9NWD9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEX4Q9NWD9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEX4Q9NWD9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEX4Q9NWD9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEX4Q9NWD9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEX4Q9NWD9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEX4Q9NWD9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BEX4Q9NWD9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEX4Q9NWD9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEX4Q9NWD9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEX4Q9NWD9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEX4Q9NWD9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEX4Q9NWD9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BEX4Q9NWD9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEX4Q9NWD9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEX4Q9NWD9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEX4Q9NWD9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEX4Q9NWD9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEX4Q9NWD9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BEX4Q9NWD9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEX4Q9NWD9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEX4Q9NWD9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEX4Q9NWD9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BEX4Q9NWD9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEX4Q9NWD9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BEX4Q9NWD9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BEX4Q9NWD9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BEX4Q9NWD9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEX4Q9NWD9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BEX4Q9NWD9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEX4Q9NWD9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEX4Q9NWD9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEX4Q9NWD9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEX4Q9NWD9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEX4Q9NWD9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEX4Q9NWD9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEX4Q9NWD9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BEX4Q9NWD9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEX4Q9NWD9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEX4Q9NWD9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BEX4Q9NWD9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEX4Q9NWD9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEX4Q9NWD9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BEX4Q9NWD9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BEX4Q9NWD9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BEX4Q9NWD9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BEX4Q9NWD9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BEX4Q9NWD9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEX4Q9NWD9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEX4Q9NWD9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BEX4Q9NWD9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BEX4Q9NWD9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BEX4Q9NWD9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEX4Q9NWD9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEX4Q9NWD9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BEX4Q9NWD9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEX4Q9NWD9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
BEX4Q9NWD9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEX4Q9NWD9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BEX4Q9NWD9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEX4Q9NWD9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BEX4Q9NWD9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms