Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
FANCIQ9NVI1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
FANCIQ9NVI1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
FANCIQ9NVI1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
FANCIQ9NVI1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
FANCIQ9NVI1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
FANCIQ9NVI1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
FANCIQ9NVI1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
FANCIQ9NVI1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
FANCIQ9NVI1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
FANCIQ9NVI1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
FANCIQ9NVI1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
FANCIQ9NVI1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
FANCIQ9NVI1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
FANCIQ9NVI1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
FANCIQ9NVI1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC34.5■■■■□ 3.11
FANCIQ9NVI1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
FANCIQ9NVI1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
FANCIQ9NVI1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
FANCIQ9NVI1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
FANCIQ9NVI1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
FANCIQ9NVI1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
FANCIQ9NVI1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
FANCIQ9NVI1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
FANCIQ9NVI1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
FANCIQ9NVI1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
FANCIQ9NVI1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
FANCIQ9NVI1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
FANCIQ9NVI1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
FANCIQ9NVI1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
FANCIQ9NVI1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
FANCIQ9NVI1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
FANCIQ9NVI1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
FANCIQ9NVI1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
FANCIQ9NVI1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
FANCIQ9NVI1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
FANCIQ9NVI1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
FANCIQ9NVI1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
FANCIQ9NVI1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
FANCIQ9NVI1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
FANCIQ9NVI1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
FANCIQ9NVI1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
FANCIQ9NVI1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
FANCIQ9NVI1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
FANCIQ9NVI1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
FANCIQ9NVI1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
FANCIQ9NVI1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
FANCIQ9NVI1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
FANCIQ9NVI1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
FANCIQ9NVI1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
FANCIQ9NVI1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
FANCIQ9NVI1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
FANCIQ9NVI1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.37■■■■□ 3.09
FANCIQ9NVI1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
FANCIQ9NVI1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
FANCIQ9NVI1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
FANCIQ9NVI1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
FANCIQ9NVI1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
FANCIQ9NVI1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
FANCIQ9NVI1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
FANCIQ9NVI1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCIQ9NVI1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCIQ9NVI1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCIQ9NVI1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCIQ9NVI1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
FANCIQ9NVI1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
FANCIQ9NVI1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.09
FANCIQ9NVI1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
FANCIQ9NVI1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
FANCIQ9NVI1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
FANCIQ9NVI1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
FANCIQ9NVI1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
FANCIQ9NVI1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
FANCIQ9NVI1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
FANCIQ9NVI1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
FANCIQ9NVI1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
FANCIQ9NVI1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
FANCIQ9NVI1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
FANCIQ9NVI1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FANCIQ9NVI1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
FANCIQ9NVI1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
FANCIQ9NVI1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
FANCIQ9NVI1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
FANCIQ9NVI1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
FANCIQ9NVI1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
FANCIQ9NVI1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
FANCIQ9NVI1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
FANCIQ9NVI1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
FANCIQ9NVI1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
FANCIQ9NVI1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
FANCIQ9NVI1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
FANCIQ9NVI1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
FANCIQ9NVI1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
FANCIQ9NVI1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
FANCIQ9NVI1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
FANCIQ9NVI1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
FANCIQ9NVI1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
FANCIQ9NVI1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
FANCIQ9NVI1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
FANCIQ9NVI1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms