Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM140Q9NV12 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM140Q9NV12 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM140Q9NV12 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM140Q9NV12 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM140Q9NV12 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM140Q9NV12 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM140Q9NV12 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM140Q9NV12 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM140Q9NV12 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM140Q9NV12 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM140Q9NV12 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM140Q9NV12 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM140Q9NV12 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM140Q9NV12 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM140Q9NV12 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM140Q9NV12 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM140Q9NV12 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM140Q9NV12 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TMEM140Q9NV12 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM140Q9NV12 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM140Q9NV12 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM140Q9NV12 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM140Q9NV12 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM140Q9NV12 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM140Q9NV12 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM140Q9NV12 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM140Q9NV12 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM140Q9NV12 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM140Q9NV12 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM140Q9NV12 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM140Q9NV12 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM140Q9NV12 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM140Q9NV12 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM140Q9NV12 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM140Q9NV12 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM140Q9NV12 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM140Q9NV12 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM140Q9NV12 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM140Q9NV12 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM140Q9NV12 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM140Q9NV12 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM140Q9NV12 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM140Q9NV12 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM140Q9NV12 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM140Q9NV12 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM140Q9NV12 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM140Q9NV12 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM140Q9NV12 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM140Q9NV12 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM140Q9NV12 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM140Q9NV12 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TMEM140Q9NV12 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM140Q9NV12 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM140Q9NV12 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TMEM140Q9NV12 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM140Q9NV12 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TMEM140Q9NV12 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM140Q9NV12 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM140Q9NV12 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TMEM140Q9NV12 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM140Q9NV12 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TMEM140Q9NV12 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TMEM140Q9NV12 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM140Q9NV12 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM140Q9NV12 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM140Q9NV12 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TMEM140Q9NV12 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM140Q9NV12 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TMEM140Q9NV12 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM140Q9NV12 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TMEM140Q9NV12 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM140Q9NV12 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM140Q9NV12 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM140Q9NV12 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM140Q9NV12 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TMEM140Q9NV12 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM140Q9NV12 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM140Q9NV12 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM140Q9NV12 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM140Q9NV12 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM140Q9NV12 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TMEM140Q9NV12 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TMEM140Q9NV12 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM140Q9NV12 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM140Q9NV12 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM140Q9NV12 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM140Q9NV12 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMEM140Q9NV12 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM140Q9NV12 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM140Q9NV12 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM140Q9NV12 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMEM140Q9NV12 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM140Q9NV12 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM140Q9NV12 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM140Q9NV12 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM140Q9NV12 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMEM140Q9NV12 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM140Q9NV12 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMEM140Q9NV12 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms