Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ86

TRIM36, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM36, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM36Q9NQ86 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM36Q9NQ86 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM36Q9NQ86 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM36Q9NQ86 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM36Q9NQ86 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM36Q9NQ86 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM36Q9NQ86 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM36Q9NQ86 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM36Q9NQ86 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM36Q9NQ86 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM36Q9NQ86 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM36Q9NQ86 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM36Q9NQ86 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM36Q9NQ86 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM36Q9NQ86 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM36Q9NQ86 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM36Q9NQ86 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM36Q9NQ86 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM36Q9NQ86 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM36Q9NQ86 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM36Q9NQ86 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM36Q9NQ86 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM36Q9NQ86 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM36Q9NQ86 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM36Q9NQ86 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM36Q9NQ86 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM36Q9NQ86 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM36Q9NQ86 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM36Q9NQ86 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM36Q9NQ86 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM36Q9NQ86 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM36Q9NQ86 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM36Q9NQ86 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM36Q9NQ86 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM36Q9NQ86 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM36Q9NQ86 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM36Q9NQ86 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM36Q9NQ86 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM36Q9NQ86 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM36Q9NQ86 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM36Q9NQ86 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM36Q9NQ86 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM36Q9NQ86 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM36Q9NQ86 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM36Q9NQ86 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM36Q9NQ86 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM36Q9NQ86 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM36Q9NQ86 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM36Q9NQ86 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM36Q9NQ86 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM36Q9NQ86 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM36Q9NQ86 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM36Q9NQ86 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM36Q9NQ86 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM36Q9NQ86 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM36Q9NQ86 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM36Q9NQ86 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM36Q9NQ86 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM36Q9NQ86 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM36Q9NQ86 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM36Q9NQ86 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM36Q9NQ86 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM36Q9NQ86 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM36Q9NQ86 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM36Q9NQ86 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM36Q9NQ86 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM36Q9NQ86 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM36Q9NQ86 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM36Q9NQ86 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM36Q9NQ86 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM36Q9NQ86 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM36Q9NQ86 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM36Q9NQ86 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM36Q9NQ86 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM36Q9NQ86 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM36Q9NQ86 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM36Q9NQ86 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM36Q9NQ86 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM36Q9NQ86 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM36Q9NQ86 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM36Q9NQ86 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM36Q9NQ86 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM36Q9NQ86 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM36Q9NQ86 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM36Q9NQ86 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM36Q9NQ86 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM36Q9NQ86 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM36Q9NQ86 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM36Q9NQ86 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM36Q9NQ86 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM36Q9NQ86 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM36Q9NQ86 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM36Q9NQ86 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM36Q9NQ86 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM36Q9NQ86 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM36Q9NQ86 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM36Q9NQ86 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM36Q9NQ86 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM36Q9NQ86 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM36Q9NQ86 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms