Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZCCHC17Q9NP64 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZCCHC17Q9NP64 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ZCCHC17Q9NP64 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZCCHC17Q9NP64 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZCCHC17Q9NP64 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZCCHC17Q9NP64 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZCCHC17Q9NP64 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZCCHC17Q9NP64 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZCCHC17Q9NP64 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ZCCHC17Q9NP64 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ZCCHC17Q9NP64 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ZCCHC17Q9NP64 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
ZCCHC17Q9NP64 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
ZCCHC17Q9NP64 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZCCHC17Q9NP64 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZCCHC17Q9NP64 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZCCHC17Q9NP64 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZCCHC17Q9NP64 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZCCHC17Q9NP64 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZCCHC17Q9NP64 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ZCCHC17Q9NP64 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ZCCHC17Q9NP64 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ZCCHC17Q9NP64 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ZCCHC17Q9NP64 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZCCHC17Q9NP64 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZCCHC17Q9NP64 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZCCHC17Q9NP64 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZCCHC17Q9NP64 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ZCCHC17Q9NP64 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ZCCHC17Q9NP64 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ZCCHC17Q9NP64 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
ZCCHC17Q9NP64 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ZCCHC17Q9NP64 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ZCCHC17Q9NP64 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ZCCHC17Q9NP64 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ZCCHC17Q9NP64 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ZCCHC17Q9NP64 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ZCCHC17Q9NP64 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ZCCHC17Q9NP64 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ZCCHC17Q9NP64 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ZCCHC17Q9NP64 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ZCCHC17Q9NP64 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ZCCHC17Q9NP64 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
ZCCHC17Q9NP64 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ZCCHC17Q9NP64 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ZCCHC17Q9NP64 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ZCCHC17Q9NP64 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ZCCHC17Q9NP64 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ZCCHC17Q9NP64 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ZCCHC17Q9NP64 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ZCCHC17Q9NP64 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZCCHC17Q9NP64 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZCCHC17Q9NP64 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZCCHC17Q9NP64 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZCCHC17Q9NP64 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZCCHC17Q9NP64 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZCCHC17Q9NP64 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZCCHC17Q9NP64 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
ZCCHC17Q9NP64 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
ZCCHC17Q9NP64 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ZCCHC17Q9NP64 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZCCHC17Q9NP64 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ZCCHC17Q9NP64 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ZCCHC17Q9NP64 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ZCCHC17Q9NP64 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ZCCHC17Q9NP64 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ZCCHC17Q9NP64 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ZCCHC17Q9NP64 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ZCCHC17Q9NP64 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
ZCCHC17Q9NP64 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
ZCCHC17Q9NP64 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
ZCCHC17Q9NP64 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ZCCHC17Q9NP64 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ZCCHC17Q9NP64 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ZCCHC17Q9NP64 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ZCCHC17Q9NP64 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ZCCHC17Q9NP64 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ZCCHC17Q9NP64 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ZCCHC17Q9NP64 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ZCCHC17Q9NP64 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
ZCCHC17Q9NP64 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ZCCHC17Q9NP64 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ZCCHC17Q9NP64 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ZCCHC17Q9NP64 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
ZCCHC17Q9NP64 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ZCCHC17Q9NP64 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ZCCHC17Q9NP64 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ZCCHC17Q9NP64 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ZCCHC17Q9NP64 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ZCCHC17Q9NP64 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ZCCHC17Q9NP64 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ZCCHC17Q9NP64 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZCCHC17Q9NP64 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZCCHC17Q9NP64 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZCCHC17Q9NP64 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZCCHC17Q9NP64 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZCCHC17Q9NP64 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ZCCHC17Q9NP64 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms