Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCQ5

GALNT9, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 9, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT9Q9HCQ5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALNT9Q9HCQ5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GALNT9Q9HCQ5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GALNT9Q9HCQ5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GALNT9Q9HCQ5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GALNT9Q9HCQ5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GALNT9Q9HCQ5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GALNT9Q9HCQ5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALNT9Q9HCQ5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GALNT9Q9HCQ5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GALNT9Q9HCQ5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GALNT9Q9HCQ5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GALNT9Q9HCQ5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GALNT9Q9HCQ5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GALNT9Q9HCQ5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GALNT9Q9HCQ5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GALNT9Q9HCQ5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GALNT9Q9HCQ5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GALNT9Q9HCQ5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GALNT9Q9HCQ5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GALNT9Q9HCQ5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GALNT9Q9HCQ5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GALNT9Q9HCQ5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GALNT9Q9HCQ5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GALNT9Q9HCQ5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GALNT9Q9HCQ5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GALNT9Q9HCQ5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GALNT9Q9HCQ5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GALNT9Q9HCQ5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GALNT9Q9HCQ5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GALNT9Q9HCQ5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GALNT9Q9HCQ5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GALNT9Q9HCQ5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GALNT9Q9HCQ5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GALNT9Q9HCQ5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GALNT9Q9HCQ5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GALNT9Q9HCQ5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GALNT9Q9HCQ5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GALNT9Q9HCQ5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GALNT9Q9HCQ5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GALNT9Q9HCQ5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GALNT9Q9HCQ5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GALNT9Q9HCQ5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GALNT9Q9HCQ5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GALNT9Q9HCQ5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GALNT9Q9HCQ5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GALNT9Q9HCQ5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GALNT9Q9HCQ5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GALNT9Q9HCQ5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GALNT9Q9HCQ5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GALNT9Q9HCQ5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GALNT9Q9HCQ5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GALNT9Q9HCQ5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GALNT9Q9HCQ5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GALNT9Q9HCQ5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GALNT9Q9HCQ5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GALNT9Q9HCQ5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GALNT9Q9HCQ5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GALNT9Q9HCQ5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GALNT9Q9HCQ5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GALNT9Q9HCQ5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GALNT9Q9HCQ5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GALNT9Q9HCQ5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GALNT9Q9HCQ5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GALNT9Q9HCQ5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GALNT9Q9HCQ5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GALNT9Q9HCQ5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GALNT9Q9HCQ5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GALNT9Q9HCQ5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GALNT9Q9HCQ5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GALNT9Q9HCQ5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GALNT9Q9HCQ5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GALNT9Q9HCQ5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GALNT9Q9HCQ5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GALNT9Q9HCQ5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GALNT9Q9HCQ5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GALNT9Q9HCQ5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GALNT9Q9HCQ5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GALNT9Q9HCQ5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GALNT9Q9HCQ5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GALNT9Q9HCQ5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GALNT9Q9HCQ5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GALNT9Q9HCQ5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GALNT9Q9HCQ5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GALNT9Q9HCQ5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GALNT9Q9HCQ5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GALNT9Q9HCQ5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GALNT9Q9HCQ5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GALNT9Q9HCQ5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GALNT9Q9HCQ5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GALNT9Q9HCQ5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GALNT9Q9HCQ5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GALNT9Q9HCQ5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GALNT9Q9HCQ5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GALNT9Q9HCQ5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GALNT9Q9HCQ5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GALNT9Q9HCQ5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GALNT9Q9HCQ5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GALNT9Q9HCQ5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GALNT9Q9HCQ5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms