Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KIAA1549Q9HCM3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIAA1549Q9HCM3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIAA1549Q9HCM3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIAA1549Q9HCM3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIAA1549Q9HCM3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KIAA1549Q9HCM3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KIAA1549Q9HCM3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIAA1549Q9HCM3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIAA1549Q9HCM3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIAA1549Q9HCM3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIAA1549Q9HCM3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIAA1549Q9HCM3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIAA1549Q9HCM3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIAA1549Q9HCM3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIAA1549Q9HCM3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIAA1549Q9HCM3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIAA1549Q9HCM3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KIAA1549Q9HCM3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIAA1549Q9HCM3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIAA1549Q9HCM3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIAA1549Q9HCM3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIAA1549Q9HCM3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIAA1549Q9HCM3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KIAA1549Q9HCM3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIAA1549Q9HCM3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIAA1549Q9HCM3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIAA1549Q9HCM3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIAA1549Q9HCM3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIAA1549Q9HCM3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIAA1549Q9HCM3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIAA1549Q9HCM3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KIAA1549Q9HCM3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIAA1549Q9HCM3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIAA1549Q9HCM3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIAA1549Q9HCM3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIAA1549Q9HCM3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIAA1549Q9HCM3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIAA1549Q9HCM3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KIAA1549Q9HCM3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIAA1549Q9HCM3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KIAA1549Q9HCM3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIAA1549Q9HCM3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIAA1549Q9HCM3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KIAA1549Q9HCM3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KIAA1549Q9HCM3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIAA1549Q9HCM3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KIAA1549Q9HCM3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KIAA1549Q9HCM3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KIAA1549Q9HCM3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIAA1549Q9HCM3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIAA1549Q9HCM3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIAA1549Q9HCM3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIAA1549Q9HCM3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIAA1549Q9HCM3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIAA1549Q9HCM3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIAA1549Q9HCM3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA1549Q9HCM3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA1549Q9HCM3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA1549Q9HCM3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA1549Q9HCM3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA1549Q9HCM3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIAA1549Q9HCM3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIAA1549Q9HCM3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KIAA1549Q9HCM3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIAA1549Q9HCM3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIAA1549Q9HCM3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIAA1549Q9HCM3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIAA1549Q9HCM3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIAA1549Q9HCM3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIAA1549Q9HCM3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIAA1549Q9HCM3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIAA1549Q9HCM3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIAA1549Q9HCM3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIAA1549Q9HCM3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIAA1549Q9HCM3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIAA1549Q9HCM3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
KIAA1549Q9HCM3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIAA1549Q9HCM3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIAA1549Q9HCM3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIAA1549Q9HCM3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIAA1549Q9HCM3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIAA1549Q9HCM3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIAA1549Q9HCM3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIAA1549Q9HCM3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIAA1549Q9HCM3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIAA1549Q9HCM3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIAA1549Q9HCM3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIAA1549Q9HCM3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KIAA1549Q9HCM3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIAA1549Q9HCM3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIAA1549Q9HCM3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KIAA1549Q9HCM3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIAA1549Q9HCM3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIAA1549Q9HCM3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIAA1549Q9HCM3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIAA1549Q9HCM3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIAA1549Q9HCM3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIAA1549Q9HCM3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KIAA1549Q9HCM3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms