Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB40

SCPEP1, Retinoid-inducible serine carboxypeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCPEP1Q9HB40 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCPEP1Q9HB40 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCPEP1Q9HB40 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SCPEP1Q9HB40 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCPEP1Q9HB40 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCPEP1Q9HB40 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCPEP1Q9HB40 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCPEP1Q9HB40 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCPEP1Q9HB40 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCPEP1Q9HB40 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCPEP1Q9HB40 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCPEP1Q9HB40 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCPEP1Q9HB40 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCPEP1Q9HB40 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCPEP1Q9HB40 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCPEP1Q9HB40 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCPEP1Q9HB40 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCPEP1Q9HB40 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCPEP1Q9HB40 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCPEP1Q9HB40 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCPEP1Q9HB40 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCPEP1Q9HB40 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCPEP1Q9HB40 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCPEP1Q9HB40 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCPEP1Q9HB40 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCPEP1Q9HB40 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCPEP1Q9HB40 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCPEP1Q9HB40 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCPEP1Q9HB40 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCPEP1Q9HB40 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCPEP1Q9HB40 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCPEP1Q9HB40 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCPEP1Q9HB40 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCPEP1Q9HB40 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCPEP1Q9HB40 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCPEP1Q9HB40 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCPEP1Q9HB40 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCPEP1Q9HB40 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCPEP1Q9HB40 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCPEP1Q9HB40 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCPEP1Q9HB40 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCPEP1Q9HB40 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCPEP1Q9HB40 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCPEP1Q9HB40 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCPEP1Q9HB40 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCPEP1Q9HB40 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCPEP1Q9HB40 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCPEP1Q9HB40 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCPEP1Q9HB40 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCPEP1Q9HB40 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCPEP1Q9HB40 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCPEP1Q9HB40 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCPEP1Q9HB40 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCPEP1Q9HB40 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCPEP1Q9HB40 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCPEP1Q9HB40 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCPEP1Q9HB40 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCPEP1Q9HB40 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCPEP1Q9HB40 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCPEP1Q9HB40 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCPEP1Q9HB40 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCPEP1Q9HB40 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCPEP1Q9HB40 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCPEP1Q9HB40 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCPEP1Q9HB40 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCPEP1Q9HB40 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCPEP1Q9HB40 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCPEP1Q9HB40 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCPEP1Q9HB40 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCPEP1Q9HB40 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCPEP1Q9HB40 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCPEP1Q9HB40 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCPEP1Q9HB40 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCPEP1Q9HB40 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SCPEP1Q9HB40 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCPEP1Q9HB40 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCPEP1Q9HB40 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCPEP1Q9HB40 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCPEP1Q9HB40 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCPEP1Q9HB40 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCPEP1Q9HB40 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCPEP1Q9HB40 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCPEP1Q9HB40 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCPEP1Q9HB40 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCPEP1Q9HB40 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCPEP1Q9HB40 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCPEP1Q9HB40 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCPEP1Q9HB40 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCPEP1Q9HB40 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCPEP1Q9HB40 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCPEP1Q9HB40 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCPEP1Q9HB40 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCPEP1Q9HB40 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCPEP1Q9HB40 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCPEP1Q9HB40 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCPEP1Q9HB40 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCPEP1Q9HB40 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCPEP1Q9HB40 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCPEP1Q9HB40 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCPEP1Q9HB40 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms