Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3R5

CENPH, Centromere protein H, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPHQ9H3R5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPHQ9H3R5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CENPHQ9H3R5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPHQ9H3R5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPHQ9H3R5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPHQ9H3R5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPHQ9H3R5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPHQ9H3R5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPHQ9H3R5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPHQ9H3R5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPHQ9H3R5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CENPHQ9H3R5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CENPHQ9H3R5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPHQ9H3R5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPHQ9H3R5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CENPHQ9H3R5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CENPHQ9H3R5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPHQ9H3R5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPHQ9H3R5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPHQ9H3R5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPHQ9H3R5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPHQ9H3R5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPHQ9H3R5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPHQ9H3R5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPHQ9H3R5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPHQ9H3R5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPHQ9H3R5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPHQ9H3R5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CENPHQ9H3R5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPHQ9H3R5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CENPHQ9H3R5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPHQ9H3R5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPHQ9H3R5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPHQ9H3R5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPHQ9H3R5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CENPHQ9H3R5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPHQ9H3R5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPHQ9H3R5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CENPHQ9H3R5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPHQ9H3R5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CENPHQ9H3R5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPHQ9H3R5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CENPHQ9H3R5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPHQ9H3R5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPHQ9H3R5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPHQ9H3R5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPHQ9H3R5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPHQ9H3R5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPHQ9H3R5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPHQ9H3R5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPHQ9H3R5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPHQ9H3R5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPHQ9H3R5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPHQ9H3R5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPHQ9H3R5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPHQ9H3R5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPHQ9H3R5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPHQ9H3R5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPHQ9H3R5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPHQ9H3R5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPHQ9H3R5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPHQ9H3R5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPHQ9H3R5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPHQ9H3R5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPHQ9H3R5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CENPHQ9H3R5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CENPHQ9H3R5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CENPHQ9H3R5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPHQ9H3R5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPHQ9H3R5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPHQ9H3R5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CENPHQ9H3R5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPHQ9H3R5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPHQ9H3R5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPHQ9H3R5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CENPHQ9H3R5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPHQ9H3R5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPHQ9H3R5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPHQ9H3R5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CENPHQ9H3R5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPHQ9H3R5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPHQ9H3R5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CENPHQ9H3R5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CENPHQ9H3R5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CENPHQ9H3R5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CENPHQ9H3R5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CENPHQ9H3R5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CENPHQ9H3R5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CENPHQ9H3R5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPHQ9H3R5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPHQ9H3R5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPHQ9H3R5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CENPHQ9H3R5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPHQ9H3R5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPHQ9H3R5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CENPHQ9H3R5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CENPHQ9H3R5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPHQ9H3R5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPHQ9H3R5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CENPHQ9H3R5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms