Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C2

ARV1, Protein ARV1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARV1Q9H2C2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ARV1Q9H2C2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARV1Q9H2C2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARV1Q9H2C2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARV1Q9H2C2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ARV1Q9H2C2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARV1Q9H2C2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARV1Q9H2C2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARV1Q9H2C2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARV1Q9H2C2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARV1Q9H2C2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARV1Q9H2C2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARV1Q9H2C2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARV1Q9H2C2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARV1Q9H2C2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARV1Q9H2C2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARV1Q9H2C2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARV1Q9H2C2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARV1Q9H2C2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARV1Q9H2C2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ARV1Q9H2C2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARV1Q9H2C2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARV1Q9H2C2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARV1Q9H2C2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARV1Q9H2C2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ARV1Q9H2C2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARV1Q9H2C2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARV1Q9H2C2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARV1Q9H2C2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ARV1Q9H2C2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARV1Q9H2C2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ARV1Q9H2C2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ARV1Q9H2C2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ARV1Q9H2C2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARV1Q9H2C2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARV1Q9H2C2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ARV1Q9H2C2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ARV1Q9H2C2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ARV1Q9H2C2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARV1Q9H2C2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARV1Q9H2C2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARV1Q9H2C2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ARV1Q9H2C2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARV1Q9H2C2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARV1Q9H2C2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ARV1Q9H2C2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ARV1Q9H2C2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARV1Q9H2C2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ARV1Q9H2C2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARV1Q9H2C2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARV1Q9H2C2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARV1Q9H2C2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ARV1Q9H2C2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARV1Q9H2C2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ARV1Q9H2C2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARV1Q9H2C2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARV1Q9H2C2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ARV1Q9H2C2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARV1Q9H2C2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARV1Q9H2C2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ARV1Q9H2C2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARV1Q9H2C2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARV1Q9H2C2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ARV1Q9H2C2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARV1Q9H2C2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ARV1Q9H2C2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARV1Q9H2C2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARV1Q9H2C2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARV1Q9H2C2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARV1Q9H2C2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ARV1Q9H2C2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARV1Q9H2C2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARV1Q9H2C2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ARV1Q9H2C2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARV1Q9H2C2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ARV1Q9H2C2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ARV1Q9H2C2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARV1Q9H2C2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARV1Q9H2C2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARV1Q9H2C2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARV1Q9H2C2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARV1Q9H2C2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARV1Q9H2C2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARV1Q9H2C2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ARV1Q9H2C2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ARV1Q9H2C2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARV1Q9H2C2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARV1Q9H2C2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ARV1Q9H2C2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARV1Q9H2C2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARV1Q9H2C2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ARV1Q9H2C2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARV1Q9H2C2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARV1Q9H2C2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ARV1Q9H2C2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARV1Q9H2C2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ARV1Q9H2C2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARV1Q9H2C2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARV1Q9H2C2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ARV1Q9H2C2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms