Protein–RNA interactions for Protein: Q9H161

ALX4, Homeobox protein aristaless-like 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX4Q9H161 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALX4Q9H161 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALX4Q9H161 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALX4Q9H161 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALX4Q9H161 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALX4Q9H161 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALX4Q9H161 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALX4Q9H161 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALX4Q9H161 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALX4Q9H161 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALX4Q9H161 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALX4Q9H161 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALX4Q9H161 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALX4Q9H161 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ALX4Q9H161 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALX4Q9H161 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ALX4Q9H161 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALX4Q9H161 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALX4Q9H161 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALX4Q9H161 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALX4Q9H161 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALX4Q9H161 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALX4Q9H161 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALX4Q9H161 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALX4Q9H161 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALX4Q9H161 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALX4Q9H161 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALX4Q9H161 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALX4Q9H161 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALX4Q9H161 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALX4Q9H161 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALX4Q9H161 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALX4Q9H161 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALX4Q9H161 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALX4Q9H161 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALX4Q9H161 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALX4Q9H161 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALX4Q9H161 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALX4Q9H161 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALX4Q9H161 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ALX4Q9H161 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALX4Q9H161 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALX4Q9H161 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ALX4Q9H161 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALX4Q9H161 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALX4Q9H161 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALX4Q9H161 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALX4Q9H161 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALX4Q9H161 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALX4Q9H161 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ALX4Q9H161 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALX4Q9H161 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALX4Q9H161 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALX4Q9H161 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALX4Q9H161 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ALX4Q9H161 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALX4Q9H161 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALX4Q9H161 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALX4Q9H161 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALX4Q9H161 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALX4Q9H161 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALX4Q9H161 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALX4Q9H161 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALX4Q9H161 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALX4Q9H161 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALX4Q9H161 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALX4Q9H161 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALX4Q9H161 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALX4Q9H161 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALX4Q9H161 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALX4Q9H161 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALX4Q9H161 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALX4Q9H161 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALX4Q9H161 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALX4Q9H161 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALX4Q9H161 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALX4Q9H161 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALX4Q9H161 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALX4Q9H161 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALX4Q9H161 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALX4Q9H161 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALX4Q9H161 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALX4Q9H161 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALX4Q9H161 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALX4Q9H161 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALX4Q9H161 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALX4Q9H161 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ALX4Q9H161 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALX4Q9H161 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALX4Q9H161 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALX4Q9H161 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALX4Q9H161 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALX4Q9H161 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALX4Q9H161 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALX4Q9H161 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALX4Q9H161 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALX4Q9H161 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALX4Q9H161 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ALX4Q9H161 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALX4Q9H161 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms