Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHACTR1Q9C0D0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHACTR1Q9C0D0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PHACTR1Q9C0D0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHACTR1Q9C0D0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHACTR1Q9C0D0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PHACTR1Q9C0D0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PHACTR1Q9C0D0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PHACTR1Q9C0D0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHACTR1Q9C0D0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHACTR1Q9C0D0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHACTR1Q9C0D0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHACTR1Q9C0D0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHACTR1Q9C0D0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHACTR1Q9C0D0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHACTR1Q9C0D0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHACTR1Q9C0D0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHACTR1Q9C0D0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHACTR1Q9C0D0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHACTR1Q9C0D0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHACTR1Q9C0D0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHACTR1Q9C0D0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHACTR1Q9C0D0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHACTR1Q9C0D0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHACTR1Q9C0D0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHACTR1Q9C0D0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHACTR1Q9C0D0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHACTR1Q9C0D0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHACTR1Q9C0D0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHACTR1Q9C0D0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHACTR1Q9C0D0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHACTR1Q9C0D0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHACTR1Q9C0D0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHACTR1Q9C0D0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHACTR1Q9C0D0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHACTR1Q9C0D0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHACTR1Q9C0D0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHACTR1Q9C0D0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHACTR1Q9C0D0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHACTR1Q9C0D0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHACTR1Q9C0D0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHACTR1Q9C0D0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHACTR1Q9C0D0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHACTR1Q9C0D0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHACTR1Q9C0D0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHACTR1Q9C0D0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHACTR1Q9C0D0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHACTR1Q9C0D0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHACTR1Q9C0D0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHACTR1Q9C0D0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHACTR1Q9C0D0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PHACTR1Q9C0D0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PHACTR1Q9C0D0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PHACTR1Q9C0D0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PHACTR1Q9C0D0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHACTR1Q9C0D0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHACTR1Q9C0D0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHACTR1Q9C0D0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PHACTR1Q9C0D0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHACTR1Q9C0D0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PHACTR1Q9C0D0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHACTR1Q9C0D0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHACTR1Q9C0D0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PHACTR1Q9C0D0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHACTR1Q9C0D0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHACTR1Q9C0D0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PHACTR1Q9C0D0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHACTR1Q9C0D0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHACTR1Q9C0D0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PHACTR1Q9C0D0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PHACTR1Q9C0D0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHACTR1Q9C0D0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHACTR1Q9C0D0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHACTR1Q9C0D0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PHACTR1Q9C0D0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHACTR1Q9C0D0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHACTR1Q9C0D0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHACTR1Q9C0D0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHACTR1Q9C0D0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PHACTR1Q9C0D0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHACTR1Q9C0D0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHACTR1Q9C0D0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHACTR1Q9C0D0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHACTR1Q9C0D0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHACTR1Q9C0D0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PHACTR1Q9C0D0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHACTR1Q9C0D0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHACTR1Q9C0D0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHACTR1Q9C0D0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHACTR1Q9C0D0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHACTR1Q9C0D0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PHACTR1Q9C0D0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PHACTR1Q9C0D0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PHACTR1Q9C0D0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PHACTR1Q9C0D0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PHACTR1Q9C0D0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PHACTR1Q9C0D0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PHACTR1Q9C0D0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PHACTR1Q9C0D0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms