Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMES1Q9C002 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NMES1Q9C002 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NMES1Q9C002 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NMES1Q9C002 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NMES1Q9C002 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NMES1Q9C002 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NMES1Q9C002 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NMES1Q9C002 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NMES1Q9C002 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NMES1Q9C002 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NMES1Q9C002 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NMES1Q9C002 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NMES1Q9C002 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NMES1Q9C002 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NMES1Q9C002 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NMES1Q9C002 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NMES1Q9C002 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NMES1Q9C002 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NMES1Q9C002 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NMES1Q9C002 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NMES1Q9C002 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NMES1Q9C002 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NMES1Q9C002 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NMES1Q9C002 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NMES1Q9C002 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NMES1Q9C002 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NMES1Q9C002 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NMES1Q9C002 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NMES1Q9C002 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NMES1Q9C002 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NMES1Q9C002 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NMES1Q9C002 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NMES1Q9C002 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NMES1Q9C002 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NMES1Q9C002 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NMES1Q9C002 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NMES1Q9C002 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NMES1Q9C002 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NMES1Q9C002 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NMES1Q9C002 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NMES1Q9C002 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NMES1Q9C002 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NMES1Q9C002 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NMES1Q9C002 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NMES1Q9C002 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NMES1Q9C002 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NMES1Q9C002 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NMES1Q9C002 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NMES1Q9C002 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NMES1Q9C002 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NMES1Q9C002 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NMES1Q9C002 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NMES1Q9C002 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NMES1Q9C002 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NMES1Q9C002 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NMES1Q9C002 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NMES1Q9C002 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NMES1Q9C002 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NMES1Q9C002 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NMES1Q9C002 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NMES1Q9C002 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NMES1Q9C002 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NMES1Q9C002 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NMES1Q9C002 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NMES1Q9C002 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NMES1Q9C002 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NMES1Q9C002 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NMES1Q9C002 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NMES1Q9C002 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NMES1Q9C002 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NMES1Q9C002 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NMES1Q9C002 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NMES1Q9C002 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NMES1Q9C002 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NMES1Q9C002 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NMES1Q9C002 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NMES1Q9C002 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NMES1Q9C002 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NMES1Q9C002 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NMES1Q9C002 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NMES1Q9C002 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NMES1Q9C002 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NMES1Q9C002 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NMES1Q9C002 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NMES1Q9C002 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NMES1Q9C002 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NMES1Q9C002 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NMES1Q9C002 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NMES1Q9C002 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NMES1Q9C002 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NMES1Q9C002 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NMES1Q9C002 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NMES1Q9C002 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NMES1Q9C002 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NMES1Q9C002 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NMES1Q9C002 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NMES1Q9C002 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NMES1Q9C002 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NMES1Q9C002 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms