Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZM3

GSX2, GS homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSX2Q9BZM3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSX2Q9BZM3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSX2Q9BZM3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSX2Q9BZM3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSX2Q9BZM3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSX2Q9BZM3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GSX2Q9BZM3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GSX2Q9BZM3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSX2Q9BZM3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GSX2Q9BZM3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GSX2Q9BZM3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSX2Q9BZM3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSX2Q9BZM3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSX2Q9BZM3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSX2Q9BZM3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSX2Q9BZM3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSX2Q9BZM3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSX2Q9BZM3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSX2Q9BZM3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSX2Q9BZM3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSX2Q9BZM3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GSX2Q9BZM3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GSX2Q9BZM3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GSX2Q9BZM3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSX2Q9BZM3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSX2Q9BZM3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSX2Q9BZM3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSX2Q9BZM3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSX2Q9BZM3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSX2Q9BZM3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSX2Q9BZM3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSX2Q9BZM3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSX2Q9BZM3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSX2Q9BZM3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSX2Q9BZM3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSX2Q9BZM3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSX2Q9BZM3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSX2Q9BZM3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSX2Q9BZM3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSX2Q9BZM3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSX2Q9BZM3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSX2Q9BZM3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSX2Q9BZM3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GSX2Q9BZM3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GSX2Q9BZM3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GSX2Q9BZM3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GSX2Q9BZM3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSX2Q9BZM3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GSX2Q9BZM3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSX2Q9BZM3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSX2Q9BZM3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GSX2Q9BZM3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSX2Q9BZM3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSX2Q9BZM3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSX2Q9BZM3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSX2Q9BZM3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GSX2Q9BZM3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSX2Q9BZM3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSX2Q9BZM3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSX2Q9BZM3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSX2Q9BZM3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSX2Q9BZM3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GSX2Q9BZM3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSX2Q9BZM3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSX2Q9BZM3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSX2Q9BZM3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GSX2Q9BZM3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSX2Q9BZM3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSX2Q9BZM3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSX2Q9BZM3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSX2Q9BZM3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSX2Q9BZM3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSX2Q9BZM3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSX2Q9BZM3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GSX2Q9BZM3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GSX2Q9BZM3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSX2Q9BZM3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSX2Q9BZM3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSX2Q9BZM3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSX2Q9BZM3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSX2Q9BZM3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSX2Q9BZM3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSX2Q9BZM3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSX2Q9BZM3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GSX2Q9BZM3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSX2Q9BZM3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSX2Q9BZM3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSX2Q9BZM3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSX2Q9BZM3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSX2Q9BZM3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSX2Q9BZM3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSX2Q9BZM3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSX2Q9BZM3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSX2Q9BZM3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSX2Q9BZM3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSX2Q9BZM3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSX2Q9BZM3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSX2Q9BZM3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSX2Q9BZM3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GSX2Q9BZM3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms