Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYM8

RBCK1, RanBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBCK1Q9BYM8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RBCK1Q9BYM8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBCK1Q9BYM8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RBCK1Q9BYM8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RBCK1Q9BYM8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBCK1Q9BYM8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBCK1Q9BYM8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBCK1Q9BYM8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBCK1Q9BYM8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBCK1Q9BYM8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RBCK1Q9BYM8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RBCK1Q9BYM8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBCK1Q9BYM8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBCK1Q9BYM8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBCK1Q9BYM8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RBCK1Q9BYM8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBCK1Q9BYM8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RBCK1Q9BYM8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBCK1Q9BYM8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBCK1Q9BYM8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBCK1Q9BYM8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBCK1Q9BYM8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBCK1Q9BYM8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBCK1Q9BYM8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBCK1Q9BYM8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBCK1Q9BYM8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBCK1Q9BYM8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBCK1Q9BYM8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBCK1Q9BYM8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBCK1Q9BYM8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RBCK1Q9BYM8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBCK1Q9BYM8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBCK1Q9BYM8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBCK1Q9BYM8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBCK1Q9BYM8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBCK1Q9BYM8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBCK1Q9BYM8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBCK1Q9BYM8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBCK1Q9BYM8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBCK1Q9BYM8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBCK1Q9BYM8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBCK1Q9BYM8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBCK1Q9BYM8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBCK1Q9BYM8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBCK1Q9BYM8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBCK1Q9BYM8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RBCK1Q9BYM8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBCK1Q9BYM8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBCK1Q9BYM8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBCK1Q9BYM8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBCK1Q9BYM8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBCK1Q9BYM8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBCK1Q9BYM8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBCK1Q9BYM8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RBCK1Q9BYM8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBCK1Q9BYM8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBCK1Q9BYM8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBCK1Q9BYM8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBCK1Q9BYM8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBCK1Q9BYM8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBCK1Q9BYM8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBCK1Q9BYM8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBCK1Q9BYM8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBCK1Q9BYM8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RBCK1Q9BYM8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBCK1Q9BYM8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RBCK1Q9BYM8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBCK1Q9BYM8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBCK1Q9BYM8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBCK1Q9BYM8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBCK1Q9BYM8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBCK1Q9BYM8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBCK1Q9BYM8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBCK1Q9BYM8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBCK1Q9BYM8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBCK1Q9BYM8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBCK1Q9BYM8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBCK1Q9BYM8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RBCK1Q9BYM8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBCK1Q9BYM8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBCK1Q9BYM8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RBCK1Q9BYM8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBCK1Q9BYM8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBCK1Q9BYM8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBCK1Q9BYM8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBCK1Q9BYM8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBCK1Q9BYM8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBCK1Q9BYM8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBCK1Q9BYM8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBCK1Q9BYM8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBCK1Q9BYM8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBCK1Q9BYM8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RBCK1Q9BYM8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBCK1Q9BYM8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBCK1Q9BYM8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RBCK1Q9BYM8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBCK1Q9BYM8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBCK1Q9BYM8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBCK1Q9BYM8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RBCK1Q9BYM8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms