Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NIFKQ9BYG3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NIFKQ9BYG3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NIFKQ9BYG3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NIFKQ9BYG3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NIFKQ9BYG3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NIFKQ9BYG3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
NIFKQ9BYG3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
NIFKQ9BYG3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NIFKQ9BYG3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NIFKQ9BYG3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NIFKQ9BYG3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NIFKQ9BYG3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NIFKQ9BYG3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NIFKQ9BYG3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NIFKQ9BYG3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
NIFKQ9BYG3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NIFKQ9BYG3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NIFKQ9BYG3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NIFKQ9BYG3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NIFKQ9BYG3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NIFKQ9BYG3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NIFKQ9BYG3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NIFKQ9BYG3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NIFKQ9BYG3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
NIFKQ9BYG3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NIFKQ9BYG3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NIFKQ9BYG3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NIFKQ9BYG3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NIFKQ9BYG3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NIFKQ9BYG3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NIFKQ9BYG3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NIFKQ9BYG3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NIFKQ9BYG3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NIFKQ9BYG3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NIFKQ9BYG3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NIFKQ9BYG3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NIFKQ9BYG3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NIFKQ9BYG3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NIFKQ9BYG3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NIFKQ9BYG3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NIFKQ9BYG3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NIFKQ9BYG3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NIFKQ9BYG3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NIFKQ9BYG3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NIFKQ9BYG3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NIFKQ9BYG3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NIFKQ9BYG3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NIFKQ9BYG3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NIFKQ9BYG3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NIFKQ9BYG3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NIFKQ9BYG3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NIFKQ9BYG3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NIFKQ9BYG3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NIFKQ9BYG3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NIFKQ9BYG3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NIFKQ9BYG3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NIFKQ9BYG3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NIFKQ9BYG3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NIFKQ9BYG3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NIFKQ9BYG3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NIFKQ9BYG3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NIFKQ9BYG3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NIFKQ9BYG3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NIFKQ9BYG3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NIFKQ9BYG3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NIFKQ9BYG3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NIFKQ9BYG3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NIFKQ9BYG3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NIFKQ9BYG3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NIFKQ9BYG3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NIFKQ9BYG3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NIFKQ9BYG3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NIFKQ9BYG3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NIFKQ9BYG3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NIFKQ9BYG3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NIFKQ9BYG3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NIFKQ9BYG3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NIFKQ9BYG3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NIFKQ9BYG3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NIFKQ9BYG3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NIFKQ9BYG3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NIFKQ9BYG3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NIFKQ9BYG3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NIFKQ9BYG3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NIFKQ9BYG3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NIFKQ9BYG3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NIFKQ9BYG3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NIFKQ9BYG3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NIFKQ9BYG3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
NIFKQ9BYG3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NIFKQ9BYG3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
NIFKQ9BYG3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NIFKQ9BYG3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NIFKQ9BYG3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NIFKQ9BYG3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NIFKQ9BYG3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NIFKQ9BYG3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NIFKQ9BYG3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
NIFKQ9BYG3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms