Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
KDM5DQ9BY66 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.7■■■■□ 3.95
KDM5DQ9BY66 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
KDM5DQ9BY66 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
KDM5DQ9BY66 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
KDM5DQ9BY66 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
KDM5DQ9BY66 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
KDM5DQ9BY66 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
KDM5DQ9BY66 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
KDM5DQ9BY66 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
KDM5DQ9BY66 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC39.6■■■■□ 3.93
KDM5DQ9BY66 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
KDM5DQ9BY66 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
KDM5DQ9BY66 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
KDM5DQ9BY66 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
KDM5DQ9BY66 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
KDM5DQ9BY66 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
KDM5DQ9BY66 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
KDM5DQ9BY66 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC39.58■■■■□ 3.93
KDM5DQ9BY66 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC39.57■■■■□ 3.93
KDM5DQ9BY66 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
KDM5DQ9BY66 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
KDM5DQ9BY66 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
KDM5DQ9BY66 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
KDM5DQ9BY66 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
KDM5DQ9BY66 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
KDM5DQ9BY66 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
KDM5DQ9BY66 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
KDM5DQ9BY66 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
KDM5DQ9BY66 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
KDM5DQ9BY66 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
KDM5DQ9BY66 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
KDM5DQ9BY66 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
KDM5DQ9BY66 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
KDM5DQ9BY66 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
KDM5DQ9BY66 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
KDM5DQ9BY66 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
KDM5DQ9BY66 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC39.52■■■■□ 3.92
KDM5DQ9BY66 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
KDM5DQ9BY66 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
KDM5DQ9BY66 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
KDM5DQ9BY66 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
KDM5DQ9BY66 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
KDM5DQ9BY66 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
KDM5DQ9BY66 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
KDM5DQ9BY66 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
KDM5DQ9BY66 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.47■■■■□ 3.91
KDM5DQ9BY66 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
KDM5DQ9BY66 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
KDM5DQ9BY66 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
KDM5DQ9BY66 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
KDM5DQ9BY66 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
KDM5DQ9BY66 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
KDM5DQ9BY66 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
KDM5DQ9BY66 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
KDM5DQ9BY66 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
KDM5DQ9BY66 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC39.39■■■■□ 3.9
KDM5DQ9BY66 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC39.38■■■■□ 3.89
KDM5DQ9BY66 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
KDM5DQ9BY66 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
KDM5DQ9BY66 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
KDM5DQ9BY66 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
KDM5DQ9BY66 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
KDM5DQ9BY66 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
KDM5DQ9BY66 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
KDM5DQ9BY66 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.88
KDM5DQ9BY66 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
KDM5DQ9BY66 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
KDM5DQ9BY66 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
KDM5DQ9BY66 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
KDM5DQ9BY66 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
KDM5DQ9BY66 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC39.28■■■■□ 3.88
KDM5DQ9BY66 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
KDM5DQ9BY66 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
KDM5DQ9BY66 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
KDM5DQ9BY66 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
KDM5DQ9BY66 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
KDM5DQ9BY66 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
KDM5DQ9BY66 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
KDM5DQ9BY66 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
KDM5DQ9BY66 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
KDM5DQ9BY66 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
KDM5DQ9BY66 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
KDM5DQ9BY66 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
KDM5DQ9BY66 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
KDM5DQ9BY66 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
KDM5DQ9BY66 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
KDM5DQ9BY66 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
KDM5DQ9BY66 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
KDM5DQ9BY66 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
KDM5DQ9BY66 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
KDM5DQ9BY66 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
KDM5DQ9BY66 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
KDM5DQ9BY66 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
KDM5DQ9BY66 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
KDM5DQ9BY66 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
KDM5DQ9BY66 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
KDM5DQ9BY66 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
KDM5DQ9BY66 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
KDM5DQ9BY66 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms