Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TMEM106CQ9BVX2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TMEM106CQ9BVX2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TMEM106CQ9BVX2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TMEM106CQ9BVX2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TMEM106CQ9BVX2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TMEM106CQ9BVX2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TMEM106CQ9BVX2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TMEM106CQ9BVX2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TMEM106CQ9BVX2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TMEM106CQ9BVX2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TMEM106CQ9BVX2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TMEM106CQ9BVX2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TMEM106CQ9BVX2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TMEM106CQ9BVX2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TMEM106CQ9BVX2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TMEM106CQ9BVX2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TMEM106CQ9BVX2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TMEM106CQ9BVX2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TMEM106CQ9BVX2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TMEM106CQ9BVX2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TMEM106CQ9BVX2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TMEM106CQ9BVX2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TMEM106CQ9BVX2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TMEM106CQ9BVX2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TMEM106CQ9BVX2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TMEM106CQ9BVX2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TMEM106CQ9BVX2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TMEM106CQ9BVX2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TMEM106CQ9BVX2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TMEM106CQ9BVX2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TMEM106CQ9BVX2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMEM106CQ9BVX2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMEM106CQ9BVX2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMEM106CQ9BVX2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TMEM106CQ9BVX2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TMEM106CQ9BVX2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TMEM106CQ9BVX2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TMEM106CQ9BVX2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TMEM106CQ9BVX2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TMEM106CQ9BVX2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TMEM106CQ9BVX2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TMEM106CQ9BVX2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TMEM106CQ9BVX2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TMEM106CQ9BVX2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TMEM106CQ9BVX2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
TMEM106CQ9BVX2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TMEM106CQ9BVX2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TMEM106CQ9BVX2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMEM106CQ9BVX2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMEM106CQ9BVX2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMEM106CQ9BVX2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TMEM106CQ9BVX2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMEM106CQ9BVX2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TMEM106CQ9BVX2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TMEM106CQ9BVX2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TMEM106CQ9BVX2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TMEM106CQ9BVX2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TMEM106CQ9BVX2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMEM106CQ9BVX2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TMEM106CQ9BVX2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TMEM106CQ9BVX2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TMEM106CQ9BVX2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TMEM106CQ9BVX2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMEM106CQ9BVX2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMEM106CQ9BVX2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TMEM106CQ9BVX2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TMEM106CQ9BVX2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TMEM106CQ9BVX2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TMEM106CQ9BVX2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TMEM106CQ9BVX2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TMEM106CQ9BVX2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMEM106CQ9BVX2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMEM106CQ9BVX2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMEM106CQ9BVX2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TMEM106CQ9BVX2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TMEM106CQ9BVX2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TMEM106CQ9BVX2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TMEM106CQ9BVX2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TMEM106CQ9BVX2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TMEM106CQ9BVX2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TMEM106CQ9BVX2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMEM106CQ9BVX2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TMEM106CQ9BVX2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TMEM106CQ9BVX2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TMEM106CQ9BVX2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TMEM106CQ9BVX2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TMEM106CQ9BVX2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TMEM106CQ9BVX2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TMEM106CQ9BVX2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TMEM106CQ9BVX2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TMEM106CQ9BVX2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TMEM106CQ9BVX2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TMEM106CQ9BVX2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TMEM106CQ9BVX2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TMEM106CQ9BVX2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TMEM106CQ9BVX2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TMEM106CQ9BVX2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TMEM106CQ9BVX2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TMEM106CQ9BVX2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms