Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TUBB2BQ9BVA1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TUBB2BQ9BVA1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TUBB2BQ9BVA1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TUBB2BQ9BVA1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TUBB2BQ9BVA1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TUBB2BQ9BVA1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TUBB2BQ9BVA1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TUBB2BQ9BVA1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TUBB2BQ9BVA1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TUBB2BQ9BVA1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUBB2BQ9BVA1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBB2BQ9BVA1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBB2BQ9BVA1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBB2BQ9BVA1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBB2BQ9BVA1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBB2BQ9BVA1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBB2BQ9BVA1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TUBB2BQ9BVA1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TUBB2BQ9BVA1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TUBB2BQ9BVA1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TUBB2BQ9BVA1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TUBB2BQ9BVA1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TUBB2BQ9BVA1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TUBB2BQ9BVA1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TUBB2BQ9BVA1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TUBB2BQ9BVA1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TUBB2BQ9BVA1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TUBB2BQ9BVA1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBB2BQ9BVA1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUBB2BQ9BVA1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUBB2BQ9BVA1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUBB2BQ9BVA1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUBB2BQ9BVA1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUBB2BQ9BVA1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUBB2BQ9BVA1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TUBB2BQ9BVA1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUBB2BQ9BVA1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUBB2BQ9BVA1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TUBB2BQ9BVA1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUBB2BQ9BVA1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUBB2BQ9BVA1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUBB2BQ9BVA1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TUBB2BQ9BVA1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TUBB2BQ9BVA1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TUBB2BQ9BVA1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TUBB2BQ9BVA1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TUBB2BQ9BVA1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TUBB2BQ9BVA1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TUBB2BQ9BVA1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TUBB2BQ9BVA1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TUBB2BQ9BVA1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TUBB2BQ9BVA1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TUBB2BQ9BVA1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TUBB2BQ9BVA1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TUBB2BQ9BVA1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TUBB2BQ9BVA1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TUBB2BQ9BVA1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TUBB2BQ9BVA1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TUBB2BQ9BVA1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TUBB2BQ9BVA1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TUBB2BQ9BVA1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TUBB2BQ9BVA1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TUBB2BQ9BVA1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TUBB2BQ9BVA1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TUBB2BQ9BVA1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUBB2BQ9BVA1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUBB2BQ9BVA1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUBB2BQ9BVA1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUBB2BQ9BVA1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TUBB2BQ9BVA1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TUBB2BQ9BVA1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TUBB2BQ9BVA1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TUBB2BQ9BVA1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TUBB2BQ9BVA1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TUBB2BQ9BVA1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUBB2BQ9BVA1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TUBB2BQ9BVA1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUBB2BQ9BVA1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUBB2BQ9BVA1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUBB2BQ9BVA1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUBB2BQ9BVA1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUBB2BQ9BVA1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBB2BQ9BVA1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBB2BQ9BVA1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBB2BQ9BVA1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBB2BQ9BVA1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TUBB2BQ9BVA1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TUBB2BQ9BVA1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TUBB2BQ9BVA1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TUBB2BQ9BVA1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBB2BQ9BVA1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBB2BQ9BVA1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBB2BQ9BVA1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBB2BQ9BVA1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBB2BQ9BVA1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBB2BQ9BVA1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBB2BQ9BVA1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TUBB2BQ9BVA1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TUBB2BQ9BVA1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms