Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HDHD3Q9BSH5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HDHD3Q9BSH5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDHD3Q9BSH5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDHD3Q9BSH5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HDHD3Q9BSH5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HDHD3Q9BSH5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HDHD3Q9BSH5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDHD3Q9BSH5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDHD3Q9BSH5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDHD3Q9BSH5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HDHD3Q9BSH5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDHD3Q9BSH5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HDHD3Q9BSH5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDHD3Q9BSH5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HDHD3Q9BSH5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDHD3Q9BSH5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDHD3Q9BSH5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HDHD3Q9BSH5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDHD3Q9BSH5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDHD3Q9BSH5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDHD3Q9BSH5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDHD3Q9BSH5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HDHD3Q9BSH5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDHD3Q9BSH5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDHD3Q9BSH5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDHD3Q9BSH5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HDHD3Q9BSH5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDHD3Q9BSH5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDHD3Q9BSH5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HDHD3Q9BSH5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HDHD3Q9BSH5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDHD3Q9BSH5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HDHD3Q9BSH5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HDHD3Q9BSH5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDHD3Q9BSH5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HDHD3Q9BSH5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDHD3Q9BSH5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDHD3Q9BSH5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HDHD3Q9BSH5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HDHD3Q9BSH5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HDHD3Q9BSH5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDHD3Q9BSH5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDHD3Q9BSH5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HDHD3Q9BSH5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDHD3Q9BSH5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDHD3Q9BSH5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDHD3Q9BSH5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDHD3Q9BSH5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HDHD3Q9BSH5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDHD3Q9BSH5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HDHD3Q9BSH5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDHD3Q9BSH5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HDHD3Q9BSH5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDHD3Q9BSH5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDHD3Q9BSH5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDHD3Q9BSH5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDHD3Q9BSH5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDHD3Q9BSH5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDHD3Q9BSH5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDHD3Q9BSH5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDHD3Q9BSH5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDHD3Q9BSH5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDHD3Q9BSH5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDHD3Q9BSH5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDHD3Q9BSH5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDHD3Q9BSH5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDHD3Q9BSH5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDHD3Q9BSH5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDHD3Q9BSH5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDHD3Q9BSH5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDHD3Q9BSH5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDHD3Q9BSH5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDHD3Q9BSH5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDHD3Q9BSH5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDHD3Q9BSH5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDHD3Q9BSH5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDHD3Q9BSH5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDHD3Q9BSH5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDHD3Q9BSH5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HDHD3Q9BSH5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDHD3Q9BSH5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDHD3Q9BSH5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDHD3Q9BSH5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDHD3Q9BSH5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDHD3Q9BSH5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDHD3Q9BSH5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDHD3Q9BSH5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDHD3Q9BSH5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HDHD3Q9BSH5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDHD3Q9BSH5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDHD3Q9BSH5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDHD3Q9BSH5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDHD3Q9BSH5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDHD3Q9BSH5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDHD3Q9BSH5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDHD3Q9BSH5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDHD3Q9BSH5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDHD3Q9BSH5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDHD3Q9BSH5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms