Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TM2D3Q9BRN9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TM2D3Q9BRN9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TM2D3Q9BRN9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TM2D3Q9BRN9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TM2D3Q9BRN9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TM2D3Q9BRN9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TM2D3Q9BRN9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM2D3Q9BRN9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM2D3Q9BRN9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM2D3Q9BRN9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TM2D3Q9BRN9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TM2D3Q9BRN9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TM2D3Q9BRN9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM2D3Q9BRN9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM2D3Q9BRN9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM2D3Q9BRN9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM2D3Q9BRN9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM2D3Q9BRN9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM2D3Q9BRN9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM2D3Q9BRN9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM2D3Q9BRN9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM2D3Q9BRN9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM2D3Q9BRN9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TM2D3Q9BRN9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM2D3Q9BRN9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TM2D3Q9BRN9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM2D3Q9BRN9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM2D3Q9BRN9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TM2D3Q9BRN9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM2D3Q9BRN9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TM2D3Q9BRN9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM2D3Q9BRN9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM2D3Q9BRN9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM2D3Q9BRN9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM2D3Q9BRN9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM2D3Q9BRN9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM2D3Q9BRN9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM2D3Q9BRN9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TM2D3Q9BRN9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TM2D3Q9BRN9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TM2D3Q9BRN9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TM2D3Q9BRN9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TM2D3Q9BRN9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TM2D3Q9BRN9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TM2D3Q9BRN9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM2D3Q9BRN9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TM2D3Q9BRN9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TM2D3Q9BRN9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TM2D3Q9BRN9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM2D3Q9BRN9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM2D3Q9BRN9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM2D3Q9BRN9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM2D3Q9BRN9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM2D3Q9BRN9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM2D3Q9BRN9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM2D3Q9BRN9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TM2D3Q9BRN9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TM2D3Q9BRN9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TM2D3Q9BRN9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM2D3Q9BRN9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM2D3Q9BRN9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM2D3Q9BRN9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM2D3Q9BRN9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM2D3Q9BRN9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM2D3Q9BRN9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM2D3Q9BRN9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM2D3Q9BRN9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM2D3Q9BRN9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM2D3Q9BRN9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM2D3Q9BRN9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM2D3Q9BRN9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM2D3Q9BRN9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM2D3Q9BRN9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM2D3Q9BRN9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM2D3Q9BRN9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM2D3Q9BRN9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM2D3Q9BRN9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM2D3Q9BRN9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM2D3Q9BRN9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM2D3Q9BRN9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM2D3Q9BRN9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM2D3Q9BRN9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM2D3Q9BRN9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM2D3Q9BRN9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM2D3Q9BRN9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM2D3Q9BRN9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM2D3Q9BRN9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TM2D3Q9BRN9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TM2D3Q9BRN9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TM2D3Q9BRN9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TM2D3Q9BRN9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TM2D3Q9BRN9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TM2D3Q9BRN9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TM2D3Q9BRN9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TM2D3Q9BRN9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TM2D3Q9BRN9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TM2D3Q9BRN9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM2D3Q9BRN9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TM2D3Q9BRN9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms