Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK3

MXRA8, Matrix remodeling-associated protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXRA8Q9BRK3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MXRA8Q9BRK3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MXRA8Q9BRK3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
MXRA8Q9BRK3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MXRA8Q9BRK3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MXRA8Q9BRK3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MXRA8Q9BRK3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MXRA8Q9BRK3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
MXRA8Q9BRK3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MXRA8Q9BRK3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
MXRA8Q9BRK3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MXRA8Q9BRK3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MXRA8Q9BRK3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MXRA8Q9BRK3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MXRA8Q9BRK3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MXRA8Q9BRK3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MXRA8Q9BRK3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MXRA8Q9BRK3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MXRA8Q9BRK3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
MXRA8Q9BRK3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MXRA8Q9BRK3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MXRA8Q9BRK3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MXRA8Q9BRK3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MXRA8Q9BRK3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
MXRA8Q9BRK3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MXRA8Q9BRK3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MXRA8Q9BRK3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MXRA8Q9BRK3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MXRA8Q9BRK3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MXRA8Q9BRK3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
MXRA8Q9BRK3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MXRA8Q9BRK3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MXRA8Q9BRK3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MXRA8Q9BRK3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MXRA8Q9BRK3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MXRA8Q9BRK3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MXRA8Q9BRK3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MXRA8Q9BRK3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MXRA8Q9BRK3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MXRA8Q9BRK3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MXRA8Q9BRK3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MXRA8Q9BRK3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MXRA8Q9BRK3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MXRA8Q9BRK3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
MXRA8Q9BRK3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MXRA8Q9BRK3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
MXRA8Q9BRK3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MXRA8Q9BRK3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MXRA8Q9BRK3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MXRA8Q9BRK3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MXRA8Q9BRK3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MXRA8Q9BRK3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MXRA8Q9BRK3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MXRA8Q9BRK3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MXRA8Q9BRK3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
MXRA8Q9BRK3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MXRA8Q9BRK3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
MXRA8Q9BRK3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MXRA8Q9BRK3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MXRA8Q9BRK3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MXRA8Q9BRK3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MXRA8Q9BRK3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MXRA8Q9BRK3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MXRA8Q9BRK3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
MXRA8Q9BRK3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
MXRA8Q9BRK3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MXRA8Q9BRK3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MXRA8Q9BRK3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MXRA8Q9BRK3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MXRA8Q9BRK3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MXRA8Q9BRK3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
MXRA8Q9BRK3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
MXRA8Q9BRK3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MXRA8Q9BRK3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MXRA8Q9BRK3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MXRA8Q9BRK3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MXRA8Q9BRK3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MXRA8Q9BRK3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
MXRA8Q9BRK3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
MXRA8Q9BRK3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MXRA8Q9BRK3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MXRA8Q9BRK3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
MXRA8Q9BRK3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MXRA8Q9BRK3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MXRA8Q9BRK3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MXRA8Q9BRK3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MXRA8Q9BRK3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
MXRA8Q9BRK3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
MXRA8Q9BRK3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
MXRA8Q9BRK3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
MXRA8Q9BRK3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MXRA8Q9BRK3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
MXRA8Q9BRK3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MXRA8Q9BRK3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MXRA8Q9BRK3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MXRA8Q9BRK3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MXRA8Q9BRK3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MXRA8Q9BRK3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MXRA8Q9BRK3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MXRA8Q9BRK3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms