Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TXNDC17Q9BRA2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TXNDC17Q9BRA2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TXNDC17Q9BRA2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TXNDC17Q9BRA2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TXNDC17Q9BRA2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TXNDC17Q9BRA2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TXNDC17Q9BRA2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TXNDC17Q9BRA2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TXNDC17Q9BRA2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TXNDC17Q9BRA2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TXNDC17Q9BRA2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TXNDC17Q9BRA2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TXNDC17Q9BRA2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TXNDC17Q9BRA2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TXNDC17Q9BRA2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TXNDC17Q9BRA2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TXNDC17Q9BRA2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TXNDC17Q9BRA2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TXNDC17Q9BRA2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TXNDC17Q9BRA2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TXNDC17Q9BRA2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TXNDC17Q9BRA2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TXNDC17Q9BRA2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TXNDC17Q9BRA2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TXNDC17Q9BRA2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TXNDC17Q9BRA2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TXNDC17Q9BRA2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TXNDC17Q9BRA2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TXNDC17Q9BRA2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TXNDC17Q9BRA2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TXNDC17Q9BRA2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TXNDC17Q9BRA2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TXNDC17Q9BRA2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TXNDC17Q9BRA2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TXNDC17Q9BRA2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TXNDC17Q9BRA2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TXNDC17Q9BRA2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TXNDC17Q9BRA2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TXNDC17Q9BRA2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TXNDC17Q9BRA2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TXNDC17Q9BRA2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TXNDC17Q9BRA2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TXNDC17Q9BRA2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TXNDC17Q9BRA2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TXNDC17Q9BRA2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TXNDC17Q9BRA2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TXNDC17Q9BRA2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TXNDC17Q9BRA2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TXNDC17Q9BRA2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TXNDC17Q9BRA2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TXNDC17Q9BRA2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TXNDC17Q9BRA2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TXNDC17Q9BRA2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TXNDC17Q9BRA2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TXNDC17Q9BRA2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TXNDC17Q9BRA2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TXNDC17Q9BRA2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TXNDC17Q9BRA2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TXNDC17Q9BRA2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TXNDC17Q9BRA2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TXNDC17Q9BRA2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TXNDC17Q9BRA2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TXNDC17Q9BRA2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TXNDC17Q9BRA2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TXNDC17Q9BRA2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TXNDC17Q9BRA2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TXNDC17Q9BRA2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TXNDC17Q9BRA2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TXNDC17Q9BRA2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TXNDC17Q9BRA2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TXNDC17Q9BRA2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TXNDC17Q9BRA2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TXNDC17Q9BRA2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TXNDC17Q9BRA2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TXNDC17Q9BRA2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TXNDC17Q9BRA2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TXNDC17Q9BRA2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TXNDC17Q9BRA2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TXNDC17Q9BRA2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TXNDC17Q9BRA2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TXNDC17Q9BRA2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TXNDC17Q9BRA2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TXNDC17Q9BRA2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TXNDC17Q9BRA2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TXNDC17Q9BRA2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TXNDC17Q9BRA2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TXNDC17Q9BRA2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TXNDC17Q9BRA2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TXNDC17Q9BRA2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TXNDC17Q9BRA2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TXNDC17Q9BRA2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TXNDC17Q9BRA2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TXNDC17Q9BRA2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TXNDC17Q9BRA2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TXNDC17Q9BRA2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TXNDC17Q9BRA2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TXNDC17Q9BRA2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TXNDC17Q9BRA2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TXNDC17Q9BRA2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms